297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0178 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  100 
 
 
317 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  61.22 
 
 
312 aa  388  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  60 
 
 
318 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  60.52 
 
 
315 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  58.99 
 
 
317 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  59.35 
 
 
315 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  59.42 
 
 
317 aa  374  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  60.78 
 
 
315 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  59.03 
 
 
316 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  58.25 
 
 
318 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  59.16 
 
 
315 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  58.39 
 
 
320 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  58.71 
 
 
314 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  57.28 
 
 
316 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  59.15 
 
 
315 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  58.23 
 
 
320 aa  368  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  58.39 
 
 
320 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  56.13 
 
 
312 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  55.19 
 
 
311 aa  362  6e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  56.83 
 
 
314 aa  361  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  56.13 
 
 
312 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  57.28 
 
 
316 aa  359  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  55.81 
 
 
312 aa  358  5e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  56.77 
 
 
313 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  56.37 
 
 
313 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  56.01 
 
 
318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  56.05 
 
 
317 aa  350  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  54.81 
 
 
312 aa  350  2e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  54.49 
 
 
334 aa  348  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  56.13 
 
 
340 aa  346  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  55.63 
 
 
315 aa  345  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  55.1 
 
 
313 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  55.16 
 
 
316 aa  345  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  54.78 
 
 
313 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  55.48 
 
 
314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  54.66 
 
 
313 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  54.07 
 
 
314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  54.84 
 
 
313 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  54.34 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  53.23 
 
 
315 aa  332  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  52.88 
 
 
315 aa  332  7.000000000000001e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  48.54 
 
 
313 aa  272  6e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  46.45 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  46.45 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  42.17 
 
 
315 aa  262  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  43.08 
 
 
317 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  43.27 
 
 
317 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  42.95 
 
 
317 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  42.81 
 
 
316 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  43.4 
 
 
319 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  42.14 
 
 
317 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  43.73 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  43.57 
 
 
318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  42.59 
 
 
317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  43.23 
 
 
317 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  43.23 
 
 
317 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  43.08 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  42.9 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0322  glutathione synthetase  41.77 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  46.53 
 
 
310 aa  252  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  42.58 
 
 
317 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  41.94 
 
 
319 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  42.9 
 
 
316 aa  249  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  42.26 
 
 
315 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  44.22 
 
 
319 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  42.26 
 
 
315 aa  248  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  41.53 
 
 
318 aa  248  8e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  44.22 
 
 
319 aa  248  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  41.61 
 
 
316 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  41.94 
 
 
315 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  42.26 
 
 
315 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  41.5 
 
 
316 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  41.16 
 
 
317 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  43.88 
 
 
319 aa  246  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  41.5 
 
 
316 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  39.81 
 
 
321 aa  246  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  43.85 
 
 
318 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  42.68 
 
 
322 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  41.94 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  41.67 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  40.97 
 
 
317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  41.29 
 
 
315 aa  242  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  42.18 
 
 
318 aa  242  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  42.18 
 
 
328 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  43.05 
 
 
317 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  42.37 
 
 
317 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  43.27 
 
 
316 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  40.48 
 
 
315 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  40.48 
 
 
315 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  40.48 
 
 
315 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  40.48 
 
 
315 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  40.48 
 
 
315 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0057  glutathione synthase  40.97 
 
 
317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  42.03 
 
 
317 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  43.91 
 
 
315 aa  235  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  39.23 
 
 
315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  42.71 
 
 
319 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  40.88 
 
 
321 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  42.71 
 
 
319 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  40.88 
 
 
321 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>