More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0322 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  100 
 
 
334 aa  677    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  63.53 
 
 
317 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  63.33 
 
 
318 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  61.54 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  57.85 
 
 
312 aa  371  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  57.45 
 
 
315 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  57.98 
 
 
316 aa  371  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  58.39 
 
 
312 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  57.85 
 
 
312 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  57.45 
 
 
315 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  56.44 
 
 
311 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  57.32 
 
 
314 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  57.23 
 
 
316 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  58.15 
 
 
315 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  56.23 
 
 
315 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  56.53 
 
 
315 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  55.83 
 
 
316 aa  362  6e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  57.14 
 
 
314 aa  359  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  54.49 
 
 
317 aa  348  7e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  53.56 
 
 
314 aa  346  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  54.35 
 
 
312 aa  346  4e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  53.96 
 
 
317 aa  343  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  54.35 
 
 
315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  54.35 
 
 
318 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  54.85 
 
 
317 aa  338  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  54.6 
 
 
320 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  54.57 
 
 
320 aa  332  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  54.6 
 
 
320 aa  331  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  53.66 
 
 
315 aa  331  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  54.66 
 
 
314 aa  329  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  53.07 
 
 
316 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  52.89 
 
 
315 aa  326  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  52.15 
 
 
340 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  52.48 
 
 
313 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  53.42 
 
 
313 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  53.42 
 
 
317 aa  318  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  52.48 
 
 
313 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  52 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  51.24 
 
 
313 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  51.24 
 
 
313 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  52.15 
 
 
318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  45.94 
 
 
312 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  45.94 
 
 
312 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  42.9 
 
 
321 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  45.4 
 
 
318 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  43.96 
 
 
322 aa  262  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  41.9 
 
 
319 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  45.2 
 
 
310 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  44.04 
 
 
316 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  43.73 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  44.04 
 
 
317 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  40.73 
 
 
316 aa  257  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  43.29 
 
 
319 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  43.43 
 
 
317 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  41.59 
 
 
317 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  43.43 
 
 
317 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  41.69 
 
 
318 aa  256  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  40.98 
 
 
316 aa  255  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  42.2 
 
 
318 aa  255  8e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  42.99 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  43.71 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  40.43 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  42.38 
 
 
319 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  41.59 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0322  glutathione synthetase  40.25 
 
 
309 aa  252  6e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  41.77 
 
 
316 aa  252  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  42.51 
 
 
317 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  41.09 
 
 
317 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  41.09 
 
 
317 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  41.09 
 
 
317 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  41.09 
 
 
317 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  41.28 
 
 
315 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  41.9 
 
 
316 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  41.09 
 
 
317 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  41.28 
 
 
315 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  47.39 
 
 
313 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  40.98 
 
 
315 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  40.06 
 
 
315 aa  249  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  40.55 
 
 
328 aa  248  7e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  42.2 
 
 
317 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  43.12 
 
 
319 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  42.81 
 
 
319 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  40.91 
 
 
322 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  41.28 
 
 
316 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  39.58 
 
 
317 aa  246  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  41.59 
 
 
320 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0049  glutathione synthetase  42.33 
 
 
317 aa  245  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0437692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  43.12 
 
 
318 aa  245  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4206  glutathione synthetase  40.44 
 
 
324 aa  245  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  40.55 
 
 
317 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  41.59 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  41.59 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  41.59 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  41.59 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  41.59 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  41.59 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  41.59 
 
 
315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  41.59 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3299  glutathione synthetase  40.89 
 
 
320 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  41.28 
 
 
315 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>