More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3126 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  100 
 
 
314 aa  638    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  76.68 
 
 
340 aa  497  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  72.67 
 
 
318 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  72.03 
 
 
318 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  72.44 
 
 
313 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  72.52 
 
 
313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  72.52 
 
 
313 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  69.45 
 
 
320 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  69.77 
 
 
320 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  69.77 
 
 
320 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  71.66 
 
 
317 aa  461  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  70.29 
 
 
313 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  71.15 
 
 
313 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  69.55 
 
 
317 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  69.65 
 
 
313 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  67.63 
 
 
315 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  63.02 
 
 
315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  60.26 
 
 
315 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  60.77 
 
 
315 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  61.09 
 
 
315 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  58.65 
 
 
312 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  58.01 
 
 
316 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  58.33 
 
 
312 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  58.33 
 
 
312 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  59.05 
 
 
315 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  56.73 
 
 
312 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  58.01 
 
 
312 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  59.35 
 
 
318 aa  362  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  56.45 
 
 
317 aa  358  8e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  56.27 
 
 
316 aa  357  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  56.05 
 
 
315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  54.63 
 
 
314 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  54.95 
 
 
316 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  54.31 
 
 
314 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  55.48 
 
 
317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  54.55 
 
 
314 aa  341  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  53.63 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  52.75 
 
 
311 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  54.66 
 
 
334 aa  329  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  51.6 
 
 
315 aa  323  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  50.81 
 
 
316 aa  322  7e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  43.91 
 
 
316 aa  268  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  46.1 
 
 
312 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  46.1 
 
 
312 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  46.77 
 
 
313 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  42.04 
 
 
316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0892  glutathione synthetase  42.77 
 
 
314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1016  glutathione synthetase  42.77 
 
 
314 aa  253  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  41.67 
 
 
315 aa  251  9.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  44.7 
 
 
310 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  40.76 
 
 
317 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  40.26 
 
 
321 aa  248  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  41.99 
 
 
316 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  40.71 
 
 
317 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  40.63 
 
 
319 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  40.06 
 
 
315 aa  246  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  40.06 
 
 
315 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  40.38 
 
 
317 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  40.38 
 
 
317 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  40.06 
 
 
315 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  40.71 
 
 
317 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  40.06 
 
 
317 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  40.06 
 
 
315 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  42.17 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  41.4 
 
 
319 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  40.06 
 
 
317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  41.4 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  41.21 
 
 
318 aa  242  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  39.17 
 
 
316 aa  242  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  41.4 
 
 
319 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  40.45 
 
 
318 aa  241  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0322  glutathione synthetase  40.32 
 
 
309 aa  241  1e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  38.98 
 
 
318 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  39.17 
 
 
316 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  39.37 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0935  glutathione synthetase  40.89 
 
 
314 aa  238  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.263345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  39.49 
 
 
316 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2033  glutathione synthetase  38.91 
 
 
327 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  40.71 
 
 
316 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  41.21 
 
 
319 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  40.89 
 
 
314 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  40.26 
 
 
321 aa  235  6e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  40.26 
 
 
321 aa  235  7e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  38.59 
 
 
327 aa  235  8e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  37.82 
 
 
325 aa  233  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  40.07 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  40.58 
 
 
319 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  39.37 
 
 
315 aa  232  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  39.1 
 
 
328 aa  232  6e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  39.1 
 
 
315 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  40 
 
 
316 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  40 
 
 
316 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  39.1 
 
 
315 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  40 
 
 
316 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  40 
 
 
316 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  39.1 
 
 
315 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  40 
 
 
315 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  39.1 
 
 
315 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  39.1 
 
 
315 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2918  glutathione synthetase  39.74 
 
 
318 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>