292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5043 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  98.74 
 
 		 317 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  100 
 
 		 317 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  98.11 
 
 		 317 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  94.64 
 
 		 317 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  87.66 
 
 		 316 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  84.54 
 
 		 319 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  83.28 
 
 		 319 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  83.71 
 
 		 318 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  82.33 
 
 		 317 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  82.02 
 
 		 317 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  79.18 
 
 		 318 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  65.71 
 
 		 315 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  67.52 
 
 		 317 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  67.41 
 
 		 319 aa  431  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  67.73 
 
 		 319 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  67.73 
 
 		 319 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  66.67 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  64.97 
 
 		 318 aa  427  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  66.99 
 
 		 310 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  66.14 
 
 		 319 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  65.51 
 
 		 317 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  66.46 
 
 		 319 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  66.03 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  66.03 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  63.17 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  66.03 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  66.03 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  65.71 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  66.03 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  64.65 
 
 		 316 aa  421  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  66.03 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  66.45 
 
 		 315 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  64.13 
 
 		 319 aa  423  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  66.03 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  65.5 
 
 		 315 aa  421  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  64.33 
 
 		 317 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  65.82 
 
 		 317 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  62.74 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  64.4 
 
 		 322 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  64.74 
 
 		 315 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  63.69 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  63.49 
 
 		 317 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  64.01 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  64.74 
 
 		 315 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  64.42 
 
 		 315 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  64.74 
 
 		 315 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  64.74 
 
 		 315 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  63.81 
 
 		 316 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  62.42 
 
 		 316 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  63.69 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  63.78 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  63.46 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  63.9 
 
 		 317 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  63.38 
 
 		 316 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  63.46 
 
 		 315 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  63.38 
 
 		 317 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  61.66 
 
 		 320 aa  408  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  63.46 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  63.78 
 
 		 317 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  63.14 
 
 		 315 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  61.83 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  59.94 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0057  glutathione synthase  61.34 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  61.78 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0482  glutathione synthetase  57.96 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.580777  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  54.63 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  54.63 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  57.74 
 
 		 313 aa  364  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  56.55 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  57.88 
 
 		 316 aa  359  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  57.14 
 
 		 315 aa  358  9e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  53.18 
 
 		 329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0892  glutathione synthetase  55.63 
 
 		 314 aa  350  3e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1016  glutathione synthetase  55.31 
 
 		 314 aa  348  6e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  54.63 
 
 		 327 aa  348  6e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2033  glutathione synthetase  54.31 
 
 		 327 aa  346  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0512  glutathione synthetase  54.58 
 
 		 321 aa  342  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  53.42 
 
 		 325 aa  341  8e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0935  glutathione synthetase  56.27 
 
 		 314 aa  340  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.263345  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1810  glutathione synthetase  54.49 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1811  glutathione synthetase  53.85 
 
 		 319 aa  338  7e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  54.37 
 
 		 315 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  50.64 
 
 		 316 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  50.32 
 
 		 317 aa  312  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  49.03 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0926  glutathione synthetase  49.35 
 
 		 318 aa  308  8e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  48.39 
 
 		 323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  48.39 
 
 		 323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  50.16 
 
 		 316 aa  305  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0574  glutathione synthetase  52.56 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.918969  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4539  glutathione synthetase  48.72 
 
 		 316 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0294  glutathione synthetase  48.73 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  49.52 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  49.52 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  49.52 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  49.52 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  49.52 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  49.52 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  49.52 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  49.52 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>