More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2338 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  100 
 
 		 322 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  66.13 
 
 		 319 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  66.13 
 
 		 319 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  65.37 
 
 		 317 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  63.81 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  65.7 
 
 		 317 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  67.22 
 
 		 310 aa  421  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  64.19 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  64.19 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  64.19 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  64.19 
 
 		 315 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  62.26 
 
 		 319 aa  418  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  65.37 
 
 		 317 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  64.19 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  64.19 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  64.19 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  62.26 
 
 		 319 aa  418  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  64.19 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  64.65 
 
 		 317 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  64.65 
 
 		 317 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  64.4 
 
 		 317 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  63.87 
 
 		 316 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  63.43 
 
 		 316 aa  411  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  63.55 
 
 		 317 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  63.55 
 
 		 319 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  60.32 
 
 		 316 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  60.32 
 
 		 316 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  62.58 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  63.55 
 
 		 319 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  63.55 
 
 		 319 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  62.58 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  62.58 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  63.23 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  62.58 
 
 		 317 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  61.81 
 
 		 318 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  62.58 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  60.38 
 
 		 318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  62.26 
 
 		 315 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  60.52 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  60 
 
 		 315 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  60.32 
 
 		 316 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  59.68 
 
 		 321 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  64.61 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  60.19 
 
 		 319 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  60.65 
 
 		 316 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  63.96 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  60 
 
 		 317 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  61.66 
 
 		 316 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  58.92 
 
 		 317 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  58.92 
 
 		 317 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  59.55 
 
 		 317 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  59.68 
 
 		 315 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  60 
 
 		 315 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  58.6 
 
 		 317 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  59.42 
 
 		 317 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  61.17 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  57.19 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  59.68 
 
 		 315 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  58.15 
 
 		 317 aa  388  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  59.03 
 
 		 317 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  58.65 
 
 		 315 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  59.35 
 
 		 315 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  62.9 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  56.33 
 
 		 320 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  58.82 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  53.87 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  53.87 
 
 		 321 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0482  glutathione synthetase  55.34 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.580777  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1810  glutathione synthetase  55.27 
 
 		 319 aa  358  6e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1811  glutathione synthetase  54.63 
 
 		 319 aa  356  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  56.21 
 
 		 313 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  57.84 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0057  glutathione synthase  53.57 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0935  glutathione synthetase  56.31 
 
 		 314 aa  345  7e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.263345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  49.35 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0892  glutathione synthetase  52.94 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1016  glutathione synthetase  52.94 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  49.84 
 
 		 317 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0512  glutathione synthetase  51.29 
 
 		 321 aa  319  5e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  50.16 
 
 		 324 aa  318  9e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  50.64 
 
 		 316 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  47.9 
 
 		 323 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  47.9 
 
 		 323 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3736  glutathione synthetase  49.68 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  0.0329073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3256  glutathione synthetase  51.91 
 
 		 316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0915852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3907  glutathione synthetase  51.91 
 
 		 316 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0225291  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  50.16 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0926  glutathione synthetase  48.09 
 
 		 318 aa  305  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  48.41 
 
 		 316 aa  305  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0294  glutathione synthetase  48.08 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  48.26 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  48.26 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  48.26 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  48.26 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  48.26 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  48.26 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  48.26 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  45.25 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3909  glutathione synthetase  50.48 
 
 		 315 aa  299  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  47.8 
 
 		 318 aa  299  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>