299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0243 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  100 
 
 		 317 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0294  glutathione synthetase  82.17 
 
 		 317 aa  534  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  75.56 
 
 		 323 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  75.56 
 
 		 323 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  75.56 
 
 		 324 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  69.4 
 
 		 318 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6192  glutathione synthetase  68.24 
 
 		 318 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  68.87 
 
 		 318 aa  441  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2780  glutathione synthetase  67.92 
 
 		 318 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2918  glutathione synthetase  67.92 
 
 		 318 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  68.14 
 
 		 318 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  68.14 
 
 		 318 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  68.14 
 
 		 318 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  68.14 
 
 		 318 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  68.14 
 
 		 318 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2874  glutathione synthetase  68.87 
 
 		 318 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.235828 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  68.14 
 
 		 318 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  68.14 
 
 		 318 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0259  glutathione synthetase  68.14 
 
 		 318 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0528  glutathione synthetase  66.77 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2249  glutathione synthetase  67.92 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2863  glutathione synthetase  67.92 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3736  glutathione synthetase  65.71 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  0.0329073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4187  glutathione synthetase  66.46 
 
 		 318 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  64.01 
 
 		 316 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  66.77 
 
 		 316 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0432  glutathione synthetase  63.99 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  64.13 
 
 		 315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3909  glutathione synthetase  65.4 
 
 		 315 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4540  glutathione synthetase  63.01 
 
 		 318 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0926  glutathione synthetase  64.01 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3256  glutathione synthetase  62.42 
 
 		 316 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0915852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4539  glutathione synthetase  62.38 
 
 		 316 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3907  glutathione synthetase  62.42 
 
 		 316 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0225291  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1954  glutathione synthetase  58.15 
 
 		 313 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.280823  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  60.26 
 
 		 316 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0574  glutathione synthetase  60.06 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.918969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0010  glutathione synthetase  56.6 
 
 		 339 aa  359  4e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163572  normal  0.0543888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2409  glutathione synthase  55.95 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  54.34 
 
 		 315 aa  329  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  51.46 
 
 		 316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  52.43 
 
 		 310 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  50.16 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  50.48 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  50.32 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  50.96 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  48.72 
 
 		 320 aa  322  6e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  50.32 
 
 		 317 aa  322  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  49.84 
 
 		 322 aa  322  7e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  50.81 
 
 		 315 aa  322  7e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  49.36 
 
 		 316 aa  322  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  50.16 
 
 		 315 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  50 
 
 		 317 aa  322  8e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  50 
 
 		 317 aa  322  8e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  49.68 
 
 		 319 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  49.68 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  50.16 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  50.16 
 
 		 317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  48.42 
 
 		 317 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  49.36 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  51.27 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  49.68 
 
 		 316 aa  316  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  51.59 
 
 		 317 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  49.36 
 
 		 316 aa  316  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  50.32 
 
 		 315 aa  316  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  51.59 
 
 		 317 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  49.68 
 
 		 320 aa  315  8e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  47.62 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  50.64 
 
 		 317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  51.27 
 
 		 317 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  48.41 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  50.32 
 
 		 317 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  48.39 
 
 		 315 aa  311  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  47.48 
 
 		 319 aa  311  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  50 
 
 		 319 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  47.48 
 
 		 319 aa  310  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  50.32 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  46.98 
 
 		 316 aa  309  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  50 
 
 		 316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  49.05 
 
 		 319 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  48.41 
 
 		 319 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  48.41 
 
 		 319 aa  305  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  52.05 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  48.56 
 
 		 321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  46.82 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  48.09 
 
 		 319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  47.1 
 
 		 315 aa  302  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  48.56 
 
 		 316 aa  301  8.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  48.25 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  46.79 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  47.08 
 
 		 329 aa  299  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  46.6 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 315 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  46.65 
 
 		 315 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>