More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2780 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2780  glutathione synthetase  100 
 
 
318 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417394  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2918  glutathione synthetase  99.69 
 
 
318 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6192  glutathione synthetase  88.99 
 
 
318 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  88.36 
 
 
318 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  87.97 
 
 
318 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  87.97 
 
 
318 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  87.97 
 
 
318 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  87.97 
 
 
318 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  87.97 
 
 
318 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  87.97 
 
 
318 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  87.97 
 
 
318 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  87.97 
 
 
318 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2874  glutathione synthetase  87.11 
 
 
318 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.235828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2249  glutathione synthetase  86.48 
 
 
318 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2863  glutathione synthetase  86.48 
 
 
318 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0259  glutathione synthetase  85.13 
 
 
318 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0528  glutathione synthetase  83.91 
 
 
318 aa  554  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4187  glutathione synthetase  83.28 
 
 
318 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  67.92 
 
 
317 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  67.51 
 
 
324 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3736  glutathione synthetase  65.52 
 
 
317 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  0.0329073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0294  glutathione synthetase  68.35 
 
 
317 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0432  glutathione synthetase  64.13 
 
 
317 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  65.93 
 
 
323 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  65.62 
 
 
316 aa  421  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  65.93 
 
 
323 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3909  glutathione synthetase  65.2 
 
 
315 aa  421  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0926  glutathione synthetase  64.26 
 
 
318 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3256  glutathione synthetase  64.35 
 
 
316 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0915852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  61.76 
 
 
316 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4539  glutathione synthetase  62.03 
 
 
316 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4540  glutathione synthetase  63.12 
 
 
318 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3907  glutathione synthetase  64.35 
 
 
316 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0225291  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  63.01 
 
 
315 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1954  glutathione synthetase  58.49 
 
 
313 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.280823  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0574  glutathione synthetase  58.04 
 
 
318 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.918969  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  55.73 
 
 
316 aa  349  3e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0010  glutathione synthetase  52.65 
 
 
339 aa  339  5e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163572  normal  0.0543888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  52.26 
 
 
317 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  51.94 
 
 
317 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  51.94 
 
 
317 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  51.29 
 
 
315 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  51.61 
 
 
317 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  50.97 
 
 
315 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  50.97 
 
 
315 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  51.29 
 
 
315 aa  323  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  51.61 
 
 
317 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  51.13 
 
 
317 aa  322  7e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  49.68 
 
 
316 aa  318  9e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  51.61 
 
 
316 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  51.29 
 
 
315 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  49.21 
 
 
318 aa  315  7e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2409  glutathione synthase  52.22 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  49.68 
 
 
316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  50.31 
 
 
315 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  49.35 
 
 
317 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  50.16 
 
 
319 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  48.39 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  48.23 
 
 
316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  48.39 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  48.23 
 
 
316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  48.87 
 
 
315 aa  305  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  47.3 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2033  glutathione synthetase  48.43 
 
 
327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  49.84 
 
 
310 aa  302  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  47.8 
 
 
327 aa  301  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  49.68 
 
 
317 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  47.91 
 
 
318 aa  300  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  47.95 
 
 
319 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  47.1 
 
 
315 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  48.57 
 
 
317 aa  298  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  47.1 
 
 
315 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  47.1 
 
 
315 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  48.09 
 
 
316 aa  298  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  47.1 
 
 
315 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  47.1 
 
 
315 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  49.21 
 
 
318 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  48.87 
 
 
319 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  48.09 
 
 
317 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  50.96 
 
 
315 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  47.63 
 
 
319 aa  296  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  46.71 
 
 
325 aa  296  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  48.9 
 
 
316 aa  296  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  47.63 
 
 
319 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  47.59 
 
 
328 aa  295  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  48.1 
 
 
319 aa  295  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  47.78 
 
 
319 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  48.23 
 
 
316 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  47.91 
 
 
319 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  46.45 
 
 
316 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  46.45 
 
 
316 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  46.45 
 
 
316 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  46.45 
 
 
316 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  46.45 
 
 
316 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  46.45 
 
 
316 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  46.45 
 
 
316 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  46.45 
 
 
315 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  46.45 
 
 
316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  46.95 
 
 
315 aa  288  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  46.93 
 
 
317 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>