253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1152 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  100 
 
 		 320 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  67.62 
 
 		 329 aa  458  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  69.52 
 
 		 316 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  69.3 
 
 		 319 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  68.04 
 
 		 317 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  69.97 
 
 		 317 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  68.47 
 
 		 316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  68.79 
 
 		 317 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  68.99 
 
 		 319 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  68.57 
 
 		 317 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  68.47 
 
 		 317 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  67.62 
 
 		 319 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  69.11 
 
 		 317 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  68.99 
 
 		 319 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  69.01 
 
 		 315 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  67.41 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  68.79 
 
 		 317 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  67.41 
 
 		 319 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  68.37 
 
 		 315 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  68.69 
 
 		 315 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  67.72 
 
 		 319 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  68.27 
 
 		 315 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  67.63 
 
 		 315 aa  441  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  67.09 
 
 		 317 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  66.88 
 
 		 316 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  67.31 
 
 		 316 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  67.31 
 
 		 316 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  64.74 
 
 		 316 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  67.31 
 
 		 316 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  66.99 
 
 		 316 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  67.31 
 
 		 316 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  67.31 
 
 		 316 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  67.31 
 
 		 316 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  67.31 
 
 		 315 aa  433  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  67.31 
 
 		 316 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  66.03 
 
 		 316 aa  431  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  64.42 
 
 		 316 aa  431  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  65.5 
 
 		 315 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  65.5 
 
 		 315 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  64.86 
 
 		 315 aa  428  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  65.5 
 
 		 315 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  65.5 
 
 		 315 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  62.78 
 
 		 328 aa  424  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  65.18 
 
 		 315 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  63.58 
 
 		 320 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  63.72 
 
 		 318 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  63.69 
 
 		 318 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  62.15 
 
 		 317 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  62.38 
 
 		 319 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  62.15 
 
 		 317 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  62.78 
 
 		 317 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  61.83 
 
 		 317 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  61.51 
 
 		 317 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  61.51 
 
 		 317 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  61.44 
 
 		 319 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  60.69 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  58.6 
 
 		 315 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  59.81 
 
 		 316 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  59.81 
 
 		 317 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  58.68 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  56.33 
 
 		 322 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  59.11 
 
 		 318 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  56.96 
 
 		 310 aa  374  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0482  glutathione synthetase  57.05 
 
 		 317 aa  373  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.580777  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  57.32 
 
 		 321 aa  359  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0057  glutathione synthase  55.59 
 
 		 317 aa  355  7.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2033  glutathione synthetase  53.5 
 
 		 327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  52.87 
 
 		 327 aa  340  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  52.75 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  50.63 
 
 		 321 aa  335  5.999999999999999e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  50.63 
 
 		 321 aa  335  5.999999999999999e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  52.55 
 
 		 314 aa  328  8e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3736  glutathione synthetase  51.94 
 
 		 317 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  0.0329073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  51.45 
 
 		 316 aa  319  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  52.43 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4539  glutathione synthetase  51.13 
 
 		 316 aa  316  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  49.03 
 
 		 318 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  49.03 
 
 		 318 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  49.03 
 
 		 318 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  49.03 
 
 		 318 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  49.03 
 
 		 318 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  49.03 
 
 		 318 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  49.03 
 
 		 318 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  49.68 
 
 		 317 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  50.49 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6192  glutathione synthetase  49.35 
 
 		 318 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0935  glutathione synthetase  49.84 
 
 		 314 aa  312  5.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.263345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  48.71 
 
 		 318 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  50 
 
 		 316 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  50.79 
 
 		 315 aa  311  9e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2874  glutathione synthetase  49.03 
 
 		 318 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.235828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  49.35 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2249  glutathione synthetase  49.03 
 
 		 318 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2863  glutathione synthetase  49.03 
 
 		 318 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2918  glutathione synthetase  48.71 
 
 		 318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3256  glutathione synthetase  49.68 
 
 		 316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0915852  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2780  glutathione synthetase  48.39 
 
 		 318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3907  glutathione synthetase  49.68 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0225291  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3909  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  50.64 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>