270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1954 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1954  glutathione synthetase  100 
 
 		 313 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.280823  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3736  glutathione synthetase  60.83 
 
 		 317 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  0.0329073 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2780  glutathione synthetase  58.49 
 
 		 318 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2918  glutathione synthetase  58.49 
 
 		 318 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3909  glutathione synthetase  59.05 
 
 		 315 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  59.87 
 
 		 315 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  58.49 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  58.15 
 
 		 317 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2874  glutathione synthetase  58.49 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.235828 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  58.36 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  58.36 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  58.36 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  58.36 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  58.36 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6192  glutathione synthetase  57.86 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0528  glutathione synthetase  57.59 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  58.36 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  58.36 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  60.32 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0926  glutathione synthetase  58.92 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  58.28 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  57.86 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2249  glutathione synthetase  57.86 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0259  glutathione synthetase  58.36 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2863  glutathione synthetase  57.86 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4539  glutathione synthetase  57.88 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3256  glutathione synthetase  57.01 
 
 		 316 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0915852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3907  glutathione synthetase  57.01 
 
 		 316 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0225291  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0432  glutathione synthetase  57.05 
 
 		 317 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0294  glutathione synthetase  57.51 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4187  glutathione synthetase  56.33 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4540  glutathione synthetase  56.01 
 
 		 318 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  53.7 
 
 		 324 aa  358  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  52.41 
 
 		 323 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  52.41 
 
 		 323 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0574  glutathione synthetase  54.46 
 
 		 318 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.918969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0010  glutathione synthetase  48.11 
 
 		 339 aa  315  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163572  normal  0.0543888 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  45.37 
 
 		 325 aa  298  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2409  glutathione synthase  48.23 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  45.05 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2033  glutathione synthetase  45.05 
 
 		 327 aa  292  6e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  48.23 
 
 		 315 aa  291  8e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  44.52 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  46.01 
 
 		 320 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  46.33 
 
 		 315 aa  285  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  46.33 
 
 		 315 aa  285  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  47.78 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  46 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  46 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  44.87 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  44.09 
 
 		 317 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  46.58 
 
 		 317 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  45.51 
 
 		 316 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  46.33 
 
 		 317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  46 
 
 		 317 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  46 
 
 		 317 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  45 
 
 		 316 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  43.77 
 
 		 319 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  44.73 
 
 		 317 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  44.41 
 
 		 317 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  43.55 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  42.81 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  44.67 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  45.89 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  46 
 
 		 316 aa  279  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  43.87 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  45.69 
 
 		 316 aa  278  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  43.45 
 
 		 317 aa  278  7e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  44.73 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  46.33 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  46.33 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  48.29 
 
 		 319 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  43.04 
 
 		 318 aa  275  8e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  48.29 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  46 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  45 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  43.13 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  47.95 
 
 		 319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  43.87 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  43.77 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  43.77 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  42.86 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  42.95 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  44.52 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0057  glutathione synthase  43.55 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  44.84 
 
 		 317 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  44.66 
 
 		 316 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  44.66 
 
 		 316 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  44.66 
 
 		 316 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  44.66 
 
 		 316 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  44.52 
 
 		 319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  44.66 
 
 		 315 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  44.66 
 
 		 316 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  44.66 
 
 		 316 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  44.66 
 
 		 316 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  44.34 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  44.01 
 
 		 315 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  46.92 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  43.69 
 
 		 315 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  43.69 
 
 		 315 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>