More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2829 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  100 
 
 		 315 aa  642    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  74.19 
 
 		 314 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  72.35 
 
 		 311 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  72.12 
 
 		 316 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  71.79 
 
 		 314 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  70.83 
 
 		 314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  64.86 
 
 		 316 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  60.58 
 
 		 312 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  59.94 
 
 		 312 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  59.62 
 
 		 312 aa  381  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  59.94 
 
 		 312 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  59.49 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  57.23 
 
 		 315 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  59.03 
 
 		 315 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  59.03 
 
 		 315 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  58.71 
 
 		 315 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  59.29 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  58.73 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  58.15 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  57.51 
 
 		 316 aa  363  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  57.19 
 
 		 315 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  55.31 
 
 		 312 aa  355  5.999999999999999e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  55.73 
 
 		 317 aa  350  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  55.1 
 
 		 320 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  54.34 
 
 		 318 aa  342  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  55.1 
 
 		 320 aa  342  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  54.46 
 
 		 320 aa  341  9e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  54.63 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  52.4 
 
 		 313 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  53.99 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  53.35 
 
 		 313 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  53.97 
 
 		 317 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  53.23 
 
 		 317 aa  332  7.000000000000001e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  52.72 
 
 		 313 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  52.88 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  52.88 
 
 		 313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  52.87 
 
 		 318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  51.26 
 
 		 313 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  51.6 
 
 		 314 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  53.02 
 
 		 317 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  50.32 
 
 		 315 aa  316  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  43.91 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  43.91 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  44.3 
 
 		 319 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  43.35 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  42.72 
 
 		 316 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  40.89 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0322  glutathione synthetase  39.68 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  41.82 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  41.94 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  42.17 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  41.32 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  40.26 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  40.26 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  40.26 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  41.48 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  40.26 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  39.94 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  40.84 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  40.82 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  41.38 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  41.14 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  40.76 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  43.17 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  40.45 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  42.58 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  42.01 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 316 aa  235  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  42.09 
 
 		 318 aa  235  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  39.68 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  41.35 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  40.19 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  40.45 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3299  glutathione synthetase  40.72 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  40.45 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  41.64 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  40.45 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  41.94 
 
 		 313 aa  231  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  40.45 
 
 		 319 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  40.51 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4048  glutathione synthetase  39.5 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  39.48 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  39.68 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  41.32 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  39.94 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  40.84 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  41.72 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2121  glutathione synthetase  44.67 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>