255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3063 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  100 
 
 
312 aa  628  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  100 
 
 
312 aa  628  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  51.16 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  50.83 
 
 
321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  55.63 
 
 
310 aa  301  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  47.27 
 
 
317 aa  301  9e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  49.19 
 
 
315 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  48.71 
 
 
319 aa  300  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  48.87 
 
 
315 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  48.87 
 
 
315 aa  299  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  48.87 
 
 
315 aa  299  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  48.54 
 
 
317 aa  298  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  48.22 
 
 
317 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  48.54 
 
 
317 aa  298  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  48.22 
 
 
317 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  47.9 
 
 
317 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  48.54 
 
 
317 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  48.22 
 
 
315 aa  296  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  48.4 
 
 
317 aa  295  5e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  50.49 
 
 
322 aa  294  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  48.22 
 
 
316 aa  292  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  49.2 
 
 
317 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  46.6 
 
 
316 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  52.68 
 
 
313 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  48.54 
 
 
316 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  45.31 
 
 
321 aa  289  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  50.16 
 
 
318 aa  289  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  47.59 
 
 
316 aa  288  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  50.81 
 
 
318 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  49.84 
 
 
317 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  47.42 
 
 
316 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  49.84 
 
 
314 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  48.08 
 
 
315 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  47.74 
 
 
315 aa  285  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  48.23 
 
 
317 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  47.27 
 
 
316 aa  285  7e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  48.08 
 
 
312 aa  285  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  47.91 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  46.95 
 
 
315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  49.68 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  45.81 
 
 
317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  49.51 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  45.02 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0935  glutathione synthetase  49.36 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.263345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  46.95 
 
 
319 aa  281  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  49.36 
 
 
316 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  48.23 
 
 
319 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0512  glutathione synthetase  52.72 
 
 
321 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  47.27 
 
 
317 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  47.97 
 
 
319 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  48.55 
 
 
313 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  45.86 
 
 
317 aa  279  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  47.44 
 
 
312 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  45.31 
 
 
315 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  45.31 
 
 
315 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  47.28 
 
 
318 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  45.31 
 
 
315 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  45.31 
 
 
315 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  45.16 
 
 
315 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  46.45 
 
 
315 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  47.64 
 
 
319 aa  278  9e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  47.91 
 
 
313 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  47.59 
 
 
317 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  44.98 
 
 
315 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  46.95 
 
 
313 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  46.75 
 
 
315 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  47.91 
 
 
319 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1810  glutathione synthetase  46.79 
 
 
319 aa  276  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  47.12 
 
 
313 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  47.12 
 
 
312 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  46.62 
 
 
317 aa  276  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0057  glutathione synthase  47.91 
 
 
317 aa  275  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1811  glutathione synthetase  46.79 
 
 
319 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  47.12 
 
 
312 aa  275  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  44.69 
 
 
318 aa  275  7e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  44.12 
 
 
329 aa  275  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  47.59 
 
 
313 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  45.66 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  45.51 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  45.66 
 
 
320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  47.74 
 
 
320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  48.39 
 
 
318 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  43.55 
 
 
316 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  44.98 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  44.98 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  44.98 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  44.98 
 
 
315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  44.98 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  44.98 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  44.98 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  44.98 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  44.98 
 
 
316 aa  271  7e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  47.42 
 
 
320 aa  271  9e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  48.06 
 
 
315 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0892  glutathione synthetase  45.98 
 
 
314 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1016  glutathione synthetase  45.98 
 
 
314 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  47.27 
 
 
318 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  47.1 
 
 
320 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  47.76 
 
 
340 aa  269  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  45.83 
 
 
314 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.031905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>