More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0876 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  97.19 
 
 		 320 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  100 
 
 		 320 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  96.56 
 
 		 320 aa  630  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  81.65 
 
 		 318 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  79.25 
 
 		 318 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  79.94 
 
 		 317 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  69.77 
 
 		 314 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  68.37 
 
 		 313 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  67.85 
 
 		 313 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  68.49 
 
 		 340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  67.09 
 
 		 313 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  68.17 
 
 		 313 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  67.52 
 
 		 315 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  68.37 
 
 		 317 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  66.88 
 
 		 313 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  66.77 
 
 		 313 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  60.97 
 
 		 315 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  59.55 
 
 		 316 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  59.49 
 
 		 312 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  58.52 
 
 		 312 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  59.42 
 
 		 315 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  58.52 
 
 		 312 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  58.58 
 
 		 315 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  58.44 
 
 		 315 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  56.91 
 
 		 312 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  60.45 
 
 		 312 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  58.23 
 
 		 317 aa  368  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  57.59 
 
 		 315 aa  364  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  56.83 
 
 		 316 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  55.77 
 
 		 314 aa  363  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  57.61 
 
 		 317 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  57.01 
 
 		 315 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  57.56 
 
 		 318 aa  352  7e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  53.7 
 
 		 311 aa  348  5e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  54.98 
 
 		 316 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  54.66 
 
 		 314 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  54.46 
 
 		 315 aa  341  9e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  53.7 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  53.8 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  52.7 
 
 		 316 aa  335  5e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  54.57 
 
 		 334 aa  332  4e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  47.1 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  47.1 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  47.59 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0322  glutathione synthetase  41.59 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  41.72 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  41.72 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  41.4 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  41.27 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  41.72 
 
 		 317 aa  255  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  43.17 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  41.85 
 
 		 315 aa  255  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  40.88 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  44.34 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  41.85 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  41.53 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  41.46 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  41.35 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  41.38 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  41.38 
 
 		 319 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  40.89 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  41.38 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  42.59 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  40.58 
 
 		 316 aa  248  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  40.45 
 
 		 318 aa  248  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  42.36 
 
 		 315 aa  249  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  41.9 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  42.09 
 
 		 316 aa  248  9e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  41.53 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  41.82 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  42.31 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  43.77 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  42.77 
 
 		 317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0049  glutathione synthetase  44.09 
 
 		 317 aa  245  6e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0437692 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  44.69 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  41.72 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  41.67 
 
 		 317 aa  242  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  40.26 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  41.01 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  40.26 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  40.26 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  39.94 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  40.26 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  39.94 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  40.26 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  41.38 
 
 		 319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  44.01 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  41.01 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  40.82 
 
 		 317 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 316 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  40.25 
 
 		 322 aa  238  9e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  41.01 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  40.92 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  40.92 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2121  glutathione synthetase  45.67 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  39.68 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  39.68 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  39.68 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  39.68 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  39.94 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>