More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3546 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  100 
 
 		 315 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  84.44 
 
 		 315 aa  567  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  84.76 
 
 		 315 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  85.08 
 
 		 315 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  73.55 
 
 		 312 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  72.58 
 
 		 312 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  72.58 
 
 		 312 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  71.06 
 
 		 316 aa  481  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  67.52 
 
 		 312 aa  457  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  64.63 
 
 		 315 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  64.63 
 
 		 313 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  64.19 
 
 		 312 aa  418  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  61.81 
 
 		 318 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  63.34 
 
 		 313 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  61.74 
 
 		 317 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  63.02 
 
 		 313 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  62.7 
 
 		 313 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  63.67 
 
 		 313 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  62.9 
 
 		 318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  63.02 
 
 		 314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  63.34 
 
 		 317 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  60.65 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  61.94 
 
 		 313 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  59.68 
 
 		 314 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  61.17 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  60 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  60.97 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  59.87 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  59.37 
 
 		 317 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  58.52 
 
 		 320 aa  381  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  58.58 
 
 		 320 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  58.2 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  57.23 
 
 		 315 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  58.2 
 
 		 320 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  60.52 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  57.56 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  57.23 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  56.23 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  55.19 
 
 		 316 aa  348  8e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  52.58 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  52.27 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  46.95 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  46.95 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  49.01 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  47.1 
 
 		 322 aa  278  8e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  47.88 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  45.54 
 
 		 316 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  44.44 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  44.44 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  44.59 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  44.87 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  44.44 
 
 		 319 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  44.55 
 
 		 315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  44.27 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  43.95 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  43.91 
 
 		 319 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  44.23 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  44.23 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  44.23 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  43.91 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  43.27 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  44.23 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  45.66 
 
 		 317 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  45.02 
 
 		 317 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  43.27 
 
 		 316 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  44.69 
 
 		 316 aa  268  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  42.95 
 
 		 317 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  43.09 
 
 		 315 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  45.34 
 
 		 317 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  43.27 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  42.95 
 
 		 316 aa  266  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  42.63 
 
 		 316 aa  266  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  42.45 
 
 		 321 aa  265  7e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  45.02 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  42.95 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  42.36 
 
 		 315 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  42.58 
 
 		 320 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  42.86 
 
 		 317 aa  262  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  42.36 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  42.36 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  42.36 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  42.36 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  45.34 
 
 		 319 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  45.34 
 
 		 319 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  43.27 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  43.27 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  43.27 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  43.27 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  43.27 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  43.91 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  43.27 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  43.27 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  43.27 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  43.27 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  42.54 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  42.95 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  42.54 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  42.31 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  42.12 
 
 		 318 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  42.49 
 
 		 317 aa  258  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>