More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0324 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  100 
 
 
313 aa  635    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  92.97 
 
 
313 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  92.33 
 
 
313 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  86.26 
 
 
313 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  84.98 
 
 
313 aa  553  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  84.94 
 
 
313 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  84.35 
 
 
317 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  74.6 
 
 
318 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  72.44 
 
 
314 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  72.84 
 
 
315 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  72.2 
 
 
317 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  71.57 
 
 
318 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  67.73 
 
 
320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  67.85 
 
 
320 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  67.73 
 
 
320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  69.55 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  64.63 
 
 
315 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  64.19 
 
 
315 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  64.19 
 
 
315 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  64.52 
 
 
315 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  60.58 
 
 
312 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  60.26 
 
 
312 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  60.26 
 
 
312 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  59.11 
 
 
316 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  57.23 
 
 
312 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  59.74 
 
 
315 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  57.37 
 
 
312 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  57.88 
 
 
317 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  58.52 
 
 
318 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  56.69 
 
 
315 aa  362  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  55.45 
 
 
316 aa  355  5e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  55.13 
 
 
314 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  55.34 
 
 
314 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  55.59 
 
 
316 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  56.77 
 
 
317 aa  352  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  54.98 
 
 
317 aa  345  4e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  54.17 
 
 
314 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  53.05 
 
 
311 aa  339  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  52.72 
 
 
315 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  52.48 
 
 
334 aa  321  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  47.9 
 
 
316 aa  298  8e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  47.91 
 
 
312 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  47.91 
 
 
312 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  45.81 
 
 
313 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  47.42 
 
 
310 aa  259  6e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  42.49 
 
 
318 aa  255  8e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  41.16 
 
 
316 aa  254  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  42.54 
 
 
317 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  42.54 
 
 
317 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  44.13 
 
 
316 aa  249  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  42.86 
 
 
318 aa  248  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  40.84 
 
 
317 aa  248  8e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  42.86 
 
 
321 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  42.86 
 
 
321 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  42.04 
 
 
319 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  41.16 
 
 
317 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  42.04 
 
 
319 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  42.04 
 
 
319 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  40.84 
 
 
315 aa  246  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  40.45 
 
 
316 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  42.12 
 
 
316 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  40.19 
 
 
316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  40.58 
 
 
315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  41.16 
 
 
317 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  41.1 
 
 
319 aa  245  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  40.58 
 
 
315 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  43.23 
 
 
322 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  40.84 
 
 
317 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  43.71 
 
 
323 aa  245  6.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  40.84 
 
 
317 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  40.58 
 
 
315 aa  244  9e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  42.77 
 
 
317 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  42.9 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  41.82 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  40.51 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  40.78 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  39.23 
 
 
317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  43.27 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  41.53 
 
 
316 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  40.13 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  40.45 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  41.85 
 
 
317 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  41.69 
 
 
318 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  39.55 
 
 
315 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  41.53 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4048  glutathione synthetase  40.44 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  39.94 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  41.85 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  39.94 
 
 
315 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  39.94 
 
 
315 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  39.94 
 
 
315 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  39.94 
 
 
315 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  41.35 
 
 
317 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  41.21 
 
 
316 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4010  glutathione synthetase  40.13 
 
 
334 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  41.21 
 
 
317 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  39.68 
 
 
317 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  41.21 
 
 
319 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  39.3 
 
 
315 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  42.02 
 
 
318 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>