More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2798 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  100 
 
 		 340 aa  685    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  76.68 
 
 		 314 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  72.67 
 
 		 318 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  72.67 
 
 		 318 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  72.12 
 
 		 317 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  69.13 
 
 		 320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  68.49 
 
 		 320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  68.81 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  69.55 
 
 		 313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  69.23 
 
 		 313 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  67.95 
 
 		 315 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  67.09 
 
 		 313 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  67.41 
 
 		 313 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  67.41 
 
 		 313 aa  431  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  67.52 
 
 		 317 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  66.03 
 
 		 313 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  60.65 
 
 		 315 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  60.19 
 
 		 315 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  60.52 
 
 		 315 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  58.71 
 
 		 315 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  59.29 
 
 		 312 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  58.97 
 
 		 312 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  58.97 
 
 		 312 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  57.69 
 
 		 316 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  59.42 
 
 		 315 aa  359  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  53.7 
 
 		 312 aa  358  9.999999999999999e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  56.41 
 
 		 316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  56.09 
 
 		 314 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  56.09 
 
 		 314 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  56.41 
 
 		 312 aa  352  7e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  55.56 
 
 		 316 aa  349  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  57.1 
 
 		 317 aa  349  5e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  56.13 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  57.1 
 
 		 318 aa  346  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  54.37 
 
 		 314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  53.18 
 
 		 315 aa  336  3.9999999999999995e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  53.4 
 
 		 311 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  54.29 
 
 		 317 aa  331  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  52.88 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  53.04 
 
 		 316 aa  325  6e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  52.15 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  47.76 
 
 		 312 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  47.76 
 
 		 312 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  46.53 
 
 		 313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  40 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  40 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  39.94 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  39.62 
 
 		 317 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  39.62 
 
 		 317 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 316 aa  245  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  38.8 
 
 		 319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  38.22 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  39.94 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  42.9 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0892  glutathione synthetase  40.71 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  39.05 
 
 		 328 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1016  glutathione synthetase  40.71 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  38.26 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  40.71 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  38.26 
 
 		 315 aa  233  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  38.26 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  40 
 
 		 316 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  39.75 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  40.69 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  38.87 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  39.75 
 
 		 319 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0322  glutathione synthetase  38.71 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  38.26 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  39.75 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  38.05 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  40.59 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  40.59 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  39.35 
 
 		 322 aa  227  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  39.74 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  37.06 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  37.94 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  37.94 
 
 		 315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  37.94 
 
 		 315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  37.94 
 
 		 315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  37.94 
 
 		 315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  40.82 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1836  glutathione synthetase  38.19 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  38.66 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2121  glutathione synthetase  43.54 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3299  glutathione synthetase  39.93 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1904  glutathione synthetase  38.83 
 
 		 320 aa  220  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4048  glutathione synthetase  37.2 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4010  glutathione synthetase  36.89 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  39.23 
 
 		 317 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  37.14 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  37.14 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  36.66 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  37.14 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  38.54 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>