274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1113 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  100 
 
 
317 aa  634    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  93.25 
 
 
318 aa  590  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  80.13 
 
 
318 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  79.94 
 
 
320 aa  518  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  80.25 
 
 
320 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  79.94 
 
 
320 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  72.2 
 
 
313 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  72.12 
 
 
340 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  71.57 
 
 
315 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  69.55 
 
 
314 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  70.61 
 
 
313 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  70.61 
 
 
313 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  70.61 
 
 
313 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  71.79 
 
 
313 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  71.92 
 
 
317 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  69.97 
 
 
313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  65.16 
 
 
315 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  61.74 
 
 
315 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  62.9 
 
 
315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  62.18 
 
 
312 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  61.54 
 
 
312 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  61.54 
 
 
312 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  61.94 
 
 
315 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  60.51 
 
 
316 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  60.9 
 
 
312 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  58.52 
 
 
312 aa  383  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  58.99 
 
 
317 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  60.32 
 
 
318 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  57.83 
 
 
317 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  56.73 
 
 
314 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  59.11 
 
 
315 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  55.77 
 
 
316 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  55.59 
 
 
316 aa  359  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  55.45 
 
 
314 aa  358  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  54.98 
 
 
311 aa  358  8e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  55.45 
 
 
314 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  55.73 
 
 
315 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  55.73 
 
 
315 aa  350  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  54.85 
 
 
334 aa  338  8e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  54.66 
 
 
317 aa  338  9e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  52.1 
 
 
316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  49.68 
 
 
312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  49.68 
 
 
312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  49.5 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  43.09 
 
 
316 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  43.69 
 
 
319 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  44.69 
 
 
316 aa  263  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  44.59 
 
 
316 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  45.6 
 
 
318 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  42.81 
 
 
318 aa  259  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  42.49 
 
 
315 aa  259  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  43.81 
 
 
319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  42.49 
 
 
315 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  43.35 
 
 
316 aa  258  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  43.81 
 
 
319 aa  258  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  43.81 
 
 
319 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  41.59 
 
 
316 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  42.49 
 
 
315 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  46.45 
 
 
310 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  42.44 
 
 
317 aa  257  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  42.12 
 
 
315 aa  256  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  42.12 
 
 
317 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  42.12 
 
 
317 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  41.8 
 
 
317 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  41.77 
 
 
317 aa  255  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  44.23 
 
 
317 aa  255  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  42.12 
 
 
317 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  41.27 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  41.85 
 
 
315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  41.75 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  42.04 
 
 
316 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  41.85 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  41.85 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  41.85 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  41.85 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  41.48 
 
 
317 aa  252  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  44.13 
 
 
316 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  43.23 
 
 
322 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  42.12 
 
 
315 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  42.95 
 
 
319 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  42.41 
 
 
317 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  42.41 
 
 
317 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  42.99 
 
 
318 aa  248  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  40.13 
 
 
318 aa  248  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0322  glutathione synthetase  39.62 
 
 
309 aa  248  1e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0926  glutathione synthetase  42.77 
 
 
318 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  42.09 
 
 
317 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  40.13 
 
 
320 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  42.63 
 
 
319 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  40.51 
 
 
321 aa  246  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  42.09 
 
 
317 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  43.27 
 
 
315 aa  245  9e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  44.01 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  43.22 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  41.46 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  40.95 
 
 
317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0892  glutathione synthetase  43.09 
 
 
314 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  40.19 
 
 
315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1016  glutathione synthetase  43.09 
 
 
314 aa  242  5e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3256  glutathione synthetase  42.77 
 
 
316 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0915852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>