More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0117 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  100 
 
 		 317 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  92.01 
 
 		 313 aa  584  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  85.9 
 
 		 313 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  84.35 
 
 		 313 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  84.35 
 
 		 313 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  85.26 
 
 		 313 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  83.71 
 
 		 313 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  72.52 
 
 		 315 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  71.66 
 
 		 314 aa  461  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  71.66 
 
 		 318 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  69.72 
 
 		 318 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  71.92 
 
 		 317 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  69.13 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  68.49 
 
 		 320 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  68.37 
 
 		 320 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  67.52 
 
 		 340 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  63.34 
 
 		 315 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  63.75 
 
 		 315 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  63.43 
 
 		 315 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  62.9 
 
 		 315 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  59.94 
 
 		 316 aa  394  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  61.22 
 
 		 312 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  60.26 
 
 		 312 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  60.26 
 
 		 312 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  58.33 
 
 		 312 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  57.51 
 
 		 317 aa  364  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  58.97 
 
 		 312 aa  364  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  58.15 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  56.37 
 
 		 316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  56.05 
 
 		 315 aa  355  7.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  59.03 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  56.05 
 
 		 317 aa  350  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  54.81 
 
 		 316 aa  341  8e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  55.13 
 
 		 314 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  54.49 
 
 		 314 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  54.49 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  54.66 
 
 		 317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  52.75 
 
 		 311 aa  332  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  53.97 
 
 		 315 aa  332  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  53.42 
 
 		 334 aa  318  9e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  48.22 
 
 		 316 aa  298  8e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  47.59 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  47.59 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  48.39 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  41.8 
 
 		 317 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  41.4 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  41.4 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  41.08 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  41.08 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  42.44 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  42.31 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  40.84 
 
 		 317 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  42.31 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  40.84 
 
 		 317 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  42.17 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  41.16 
 
 		 317 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  40.76 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  42.31 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  45.16 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  40 
 
 		 316 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  42.77 
 
 		 316 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  41.08 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  41.08 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  41.08 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  40.45 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  41.08 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  41.08 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  41.08 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  41.08 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  41.08 
 
 		 315 aa  248  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  42.72 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  41.08 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  42.9 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  39.49 
 
 		 315 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  41.9 
 
 		 321 aa  244  9e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  40.45 
 
 		 319 aa  245  9e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  40.19 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  39.49 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  40.13 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  41.9 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  39.49 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  39.49 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3256  glutathione synthetase  41.72 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0915852  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  39.49 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3907  glutathione synthetase  41.72 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0225291  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  40.88 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  39.81 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  40.88 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  40.45 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  38.73 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  40.19 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  41.99 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  39.3 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  41.85 
 
 		 319 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6192  glutathione synthetase  44.3 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  40.13 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  43.32 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  41.48 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>