More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1546 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1546  glutathione synthetase  100 
 
 
309 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02531  glutathione synthetase  98.71 
 
 
309 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01961  glutathione synthetase  76.3 
 
 
308 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.072282  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27361  glutathione synthetase  70.78 
 
 
318 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01981  glutathione synthetase  67.21 
 
 
307 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0769022  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0180  glutathione synthetase  67.21 
 
 
307 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.812425  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02071  glutathione synthetase  66.56 
 
 
307 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01961  glutathione synthetase  66.23 
 
 
307 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2440  glutathione synthetase  69.31 
 
 
307 aa  428  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2121  glutathione synthetase  68.65 
 
 
307 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  44.55 
 
 
323 aa  275  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4206  glutathione synthetase  41.59 
 
 
324 aa  263  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  43.04 
 
 
322 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4010  glutathione synthetase  40.99 
 
 
334 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4048  glutathione synthetase  40.99 
 
 
334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1904  glutathione synthetase  41.14 
 
 
320 aa  258  6e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1836  glutathione synthetase  40 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3299  glutathione synthetase  39.81 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  42.62 
 
 
314 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  40.97 
 
 
321 aa  239  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  41.25 
 
 
321 aa  238  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  41.25 
 
 
321 aa  238  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  40.07 
 
 
325 aa  237  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  40.73 
 
 
316 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  41.72 
 
 
310 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  40.4 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1810  glutathione synthetase  40.32 
 
 
319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  41.69 
 
 
318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  42.48 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  41.39 
 
 
318 aa  235  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2409  glutathione synthase  41.45 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  42.57 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  41.88 
 
 
322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  41.86 
 
 
315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  42.21 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1811  glutathione synthetase  40 
 
 
319 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  42.21 
 
 
319 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  42.56 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  40.2 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  38.91 
 
 
315 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  42.52 
 
 
318 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  44.41 
 
 
319 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  42.72 
 
 
315 aa  231  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  42.72 
 
 
316 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  42.72 
 
 
316 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  42.72 
 
 
316 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  42.72 
 
 
316 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  42.72 
 
 
316 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  42.72 
 
 
316 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  43 
 
 
312 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  42.72 
 
 
316 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  43.4 
 
 
317 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  42.38 
 
 
316 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3909  glutathione synthetase  40.38 
 
 
315 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  39.68 
 
 
317 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  39.48 
 
 
328 aa  230  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  38.83 
 
 
315 aa  228  7e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  43.42 
 
 
316 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  41.86 
 
 
313 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  40.86 
 
 
315 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3736  glutathione synthetase  37.86 
 
 
317 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  0.0329073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  40.86 
 
 
316 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  39.16 
 
 
317 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  39.35 
 
 
317 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  42.11 
 
 
317 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  42.19 
 
 
317 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  41.88 
 
 
317 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  41.72 
 
 
313 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  44.08 
 
 
319 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  42.19 
 
 
317 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0935  glutathione synthetase  40.92 
 
 
314 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.263345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  40.86 
 
 
315 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  39.74 
 
 
327 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  43.99 
 
 
315 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  39.48 
 
 
317 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  40.92 
 
 
315 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  40.07 
 
 
315 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  39.16 
 
 
316 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  39.45 
 
 
319 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  39.61 
 
 
317 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  39.61 
 
 
317 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4539  glutathione synthetase  38.49 
 
 
316 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  42.19 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  40.82 
 
 
315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  39.45 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2033  glutathione synthetase  39.4 
 
 
327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0432  glutathione synthetase  37.82 
 
 
317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  39.29 
 
 
317 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  40.92 
 
 
315 aa  222  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  40.92 
 
 
315 aa  222  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  40.59 
 
 
315 aa  222  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  41.3 
 
 
315 aa  222  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  42.81 
 
 
315 aa  222  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  38.66 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  40.86 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  39.87 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  40.53 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  41.04 
 
 
314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  40.48 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  37.34 
 
 
320 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>