133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1226 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  100 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  47.68 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  50.23 
 
 		 241 aa  184  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  49.77 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  42.74 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  39.41 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  42.55 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  39.42 
 
 		 279 aa  148  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  40.96 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  42.17 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  35.06 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  34.68 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  42.52 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  34.44 
 
 		 241 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  34.8 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  35.32 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  34.02 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  33.2 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  33.61 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  33.61 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  34.39 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  33.2 
 
 		 250 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  39.63 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  33.2 
 
 		 250 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  37.5 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  38.33 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  33.78 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  37.5 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  33.33 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  35.78 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  31.6 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  33.47 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  33.49 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  30.13 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  30.96 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  28.8 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  30.25 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  28.94 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  25.42 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 94 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 94 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 94 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  21.34 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  29.35 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  26.77 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  27.17 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  31.09 
 
 		 532 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  29.63 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  25 
 
 		 501 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  27.66 
 
 		 317 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.03 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1577  histidine kinase  30.41 
 
 		 750 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.348656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  27 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  26.26 
 
 		 451 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  23.83 
 
 		 500 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  27 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  26.86 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  30.77 
 
 		 322 aa  46.6  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  31.75 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  19.05 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  27.42 
 
 		 502 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  28.57 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  29.67 
 
 		 513 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  29.24 
 
 		 522 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  28.04 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  30.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  27.86 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.22 
 
 		 641 aa  45.4  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  28.65 
 
 		 522 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  28.65 
 
 		 532 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  27.5 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3833  ABC transporter related protein  29.95 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  31.94 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.16 
 
 		 1462 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1175  branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.8 
 
 		 570 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.139317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  27.62 
 
 		 494 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  25.29 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  27.81 
 
 		 528 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3441  ABC transporter related  27.59 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0805  ABC transporter related  27.49 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1078  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.8 
 
 		 570 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0441127  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  27.51 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  22.55 
 
 		 501 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7291  ABC transporter related  22.49 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  23.77 
 
 		 504 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  31.5 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3705  ABC transporter related  27.93 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252984  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  23.98 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2303  ABC transporter related protein  30.77 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  hitchhiker  0.00211545 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  30.86 
 
 		 334 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  30.06 
 
 		 523 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  26.63 
 
 		 1455 aa  43.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  27.17 
 
 		 497 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  24.51 
 
 		 512 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 		 551 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  24.74 
 
 		 502 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  22.55 
 
 		 501 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>