163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20730 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  100 
 
 		 236 aa  490  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  47.81 
 
 		 249 aa  207  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  45.04 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  45.04 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  45.04 
 
 		 241 aa  205  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  44.63 
 
 		 241 aa  205  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  48.2 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  43.37 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  43.03 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  43.43 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  42.23 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  42.23 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  46.26 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  46.32 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  45.57 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  45.26 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  47.27 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  44.22 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  39.42 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  45.25 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  45.85 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  43.05 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  40.93 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  35.39 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  35.68 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  37.44 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  36.73 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  39.51 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  36.77 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  33.21 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  37.96 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  38.97 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  34.31 
 
 		 279 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  37.75 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  36.95 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  34.48 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  33.33 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  37.63 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  32.82 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  38.84 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  43.75 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  59.65 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  59.65 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  59.65 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  28.41 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1175  ABC transporter related  27.41 
 
 		 469 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.902135  normal  0.0612895 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29271  ABC transporter ATP-binding protein  27.98 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  25.64 
 
 		 505 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0274  ABC transporter related  25.94 
 
 		 532 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  28.8 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0976  ABC transporter related  26.34 
 
 		 463 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.684881 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0805  ABC transporter related  29.45 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1045  ABC transporter related  28.73 
 
 		 463 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00215418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  30.69 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  27.51 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  29.76 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  27.53 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  25.12 
 
 		 512 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18240  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  25.79 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  30.26 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1315  ABC transporter related  27.81 
 
 		 463 aa  47.8  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.101862  normal  0.379363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  29.35 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  25.11 
 
 		 505 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  24.21 
 
 		 531 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3233  ABC transporter related  27.01 
 
 		 500 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.405741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  25.24 
 
 		 512 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  48.84 
 
 		 623 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0814  ABC transporter related protein  28.07 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.96 
 
 		 722 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  28.16 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  23.58 
 
 		 509 aa  45.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  26.03 
 
 		 541 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.16 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  26.53 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  28.34 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  27.84 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  25.21 
 
 		 506 aa  45.1  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  23.16 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  23.7 
 
 		 530 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  27.08 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  38.36 
 
 		 336 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1064  ABC transporter related  26.04 
 
 		 504 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0465117  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  22.32 
 
 		 523 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  22.27 
 
 		 509 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  22.73 
 
 		 514 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  22.04 
 
 		 510 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.26 
 
 		 511 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  25.26 
 
 		 511 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  21.74 
 
 		 506 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  26.01 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  28.16 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  26.23 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.57 
 
 		 602 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2340  ABC transporter, ATP-binding protein  26.25 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.711037  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  24.78 
 
 		 506 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  31.19 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4316  ABC transporter related  25.89 
 
 		 528 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293814  normal  0.113849 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  28.51 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  25.27 
 
 		 501 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>