203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0436 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  55.08 
 
 		 264 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  53.44 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  51.61 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  51 
 
 		 264 aa  269  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  54.85 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  51.45 
 
 		 253 aa  264  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  51.48 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  51.48 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  52.48 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  51.29 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  50.63 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  50.63 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  48.98 
 
 		 250 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  48.57 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  49.17 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  49.59 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  48.57 
 
 		 250 aa  254  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  48.79 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  48.78 
 
 		 242 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  45.26 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  38.21 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  41.39 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  37.71 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  36.91 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  37.44 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  35.04 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  37.61 
 
 		 236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  35.43 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  35.06 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  36.36 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  32.71 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  38.68 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  34.76 
 
 		 250 aa  134  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  33.47 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  32.63 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  32.62 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  29.03 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  54.88 
 
 		 94 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  54.88 
 
 		 94 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  54.88 
 
 		 94 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  41.84 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  40.4 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0295  ABC transporter related  25.44 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.852806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  24.58 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  28.89 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  25.56 
 
 		 613 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  30.53 
 
 		 530 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  26.4 
 
 		 509 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1767  ABC transporter related  25.68 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  28.11 
 
 		 511 aa  49.3  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  28.27 
 
 		 506 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  24.1 
 
 		 478 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0418  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  25.13 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0835793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1660  ABC transporter related  24.29 
 
 		 364 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.698685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  26.22 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  27.35 
 
 		 403 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  22.91 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6816  ABC transporter related  22.53 
 
 		 512 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164745  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  22.91 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  22.91 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  22.91 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1900  ABC transporter related  27.62 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0823  ABC transporter, transmembrane region, type 1  27.44 
 
 		 558 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1831  vitamin B12-transporter ATPase  27.98 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  22.91 
 
 		 232 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  22.35 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  26.11 
 
 		 511 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1453  vitamin B12-transporter ATPase  27.98 
 
 		 245 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  25.14 
 
 		 506 aa  45.8  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1470  vitamin B12-transporter ATPase  27.98 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2003  vitamin B12-transporter ATPase  27.98 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1180  ABC transporter related  26.42 
 
 		 236 aa  45.4  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  23.46 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  24.64 
 
 		 508 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  24.64 
 
 		 510 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  24.64 
 
 		 510 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2030  DNA repair protein RecN  45.65 
 
 		 551 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  26.05 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3033  ABC peptide/opine transporter, ATPase subunit  27.17 
 
 		 333 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  24.64 
 
 		 510 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.98 
 
 		 602 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  23.88 
 
 		 589 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  27.11 
 
 		 509 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  22.42 
 
 		 512 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  27.23 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  22.35 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0245  ABC transporter related protein  28 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.197682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  26.53 
 
 		 514 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  24.17 
 
 		 504 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  24.64 
 
 		 510 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1437  vitamin B12-transporter ATPase  27.98 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0281162 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0710  cell division ATP-binding protein FtsE  23.83 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387605  normal  0.298527 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  25.73 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0765  ABC transporter related  22.86 
 
 		 511 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000101087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2400  cell division ATP-binding protein FtsE  22.6 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0253166 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00170  putative ATP-binding protein involved in cell division  23.96 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>