More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0899 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  100 
 
 		 247 aa  500  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  89.8 
 
 		 250 aa  440  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  55.95 
 
 		 279 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  46.75 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  44.16 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  45.29 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  42.74 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  39.26 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  34.78 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  35.27 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  33.48 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  33.48 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  35.04 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  32.93 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  35.95 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  33.47 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  32.53 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  32.53 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  32.13 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  37.28 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  36.4 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  32.27 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  31.71 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  33.88 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  35.32 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  36.73 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  32.9 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  34.05 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  29.7 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  36.36 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  34.78 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  28.11 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  33.2 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  28.02 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  32.47 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  27.06 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  28.33 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  25.4 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  27.35 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  28.41 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  46.43 
 
 		 94 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  46.43 
 
 		 94 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  46.43 
 
 		 94 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0302  ABC transporter related  26.96 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.353598 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  29.67 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  29.51 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1045  ABC transporter related  30.85 
 
 		 463 aa  52.4  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00215418 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  29 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  29.82 
 
 		 271 aa  52  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2051  peptide ABC transporter ATPase  36 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  24.59 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  26.13 
 
 		 738 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  25.68 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3589  ABC transporter related protein  29.68 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  26.24 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  29.57 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  28.88 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4117  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.38 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.725576  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  32.11 
 
 		 647 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.81 
 
 		 664 aa  50.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  26.18 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5078  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  30.68 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  25.59 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  26.84 
 
 		 371 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  28.89 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  28.74 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  31.82 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  29.05 
 
 		 960 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  28.88 
 
 		 288 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  30.63 
 
 		 555 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  26.01 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  25.71 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1925  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  29.21 
 
 		 358 aa  49.3  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  25.43 
 
 		 277 aa  49.3  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  30.36 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  33.14 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1268  cell division ATP-binding protein FtsE  28.16 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2014  ABC transporter related  30.23 
 
 		 534 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0103436  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  28.34 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  27.15 
 
 		 371 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  25.95 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  29.79 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  29.35 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  28.57 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  36.25 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  27.98 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  27.81 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>