121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3340 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  67.34 
 
 
264 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  63.86 
 
 
249 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  65.56 
 
 
250 aa  338  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  61.73 
 
 
250 aa  327  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  60.41 
 
 
250 aa  317  9e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  61.98 
 
 
253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  55.82 
 
 
250 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  55.87 
 
 
250 aa  289  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  55.02 
 
 
250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  55.87 
 
 
250 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  54.22 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  54.84 
 
 
241 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  54.88 
 
 
241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  58.41 
 
 
264 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  54.03 
 
 
241 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  54.47 
 
 
241 aa  280  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  54.47 
 
 
241 aa  280  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  56.6 
 
 
246 aa  267  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  48.79 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  51.54 
 
 
252 aa  247  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  51.44 
 
 
242 aa  221  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  48.91 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  47.81 
 
 
236 aa  207  9e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  39.75 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  40.08 
 
 
243 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  38.11 
 
 
238 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  38.82 
 
 
269 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  38.63 
 
 
236 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  40.78 
 
 
241 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  36.73 
 
 
238 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  35.32 
 
 
256 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  39.41 
 
 
234 aa  148  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  36.95 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  35.89 
 
 
263 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  35.32 
 
 
244 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  35.59 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  34.1 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  33.88 
 
 
247 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  33.07 
 
 
279 aa  118  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  62.03 
 
 
94 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  62.03 
 
 
94 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  62.03 
 
 
94 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  28.06 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  27.31 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  27.94 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  22.87 
 
 
272 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  26.89 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  22.66 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  29.27 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  23.53 
 
 
509 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  34.78 
 
 
482 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3322  iron ABC transporter, ATP binding protein FitB  24.41 
 
 
269 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.230871 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.35 
 
 
642 aa  46.2  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  25.12 
 
 
602 aa  46.2  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  26.32 
 
 
222 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  25.23 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  25.6 
 
 
602 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01391  ABC transporter ATP-binding protein  23.58 
 
 
227 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  23.81 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  24.45 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0295  ABC transporter related  24 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.852806  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  24.24 
 
 
602 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  23.58 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  26.89 
 
 
455 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  31.43 
 
 
452 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  25.71 
 
 
570 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  23.53 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0003  DNA replication and repair protein RecF  76 
 
 
377 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  22.94 
 
 
641 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  22.17 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  23.48 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  25.79 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  28.02 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2383  hypothetical protein  38 
 
 
93 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.450314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  24.34 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  23.58 
 
 
641 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  25.41 
 
 
647 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  26.4 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  24.75 
 
 
641 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1767  ABC transporter related  27.86 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  26.89 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1180  heme exporter protein CcmA  25.67 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  25.91 
 
 
335 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4342  iron ABC transporter, ATP binding protein FitB  23.94 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26461  ABC transporter ATP-binding protein  23.63 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29271  ABC transporter ATP-binding protein  27.32 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3441  ABC transporter related  23.32 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  30.34 
 
 
322 aa  43.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  26.91 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0668  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  22.49 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  25 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0003  recombination protein F  56.76 
 
 
364 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0185053  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0003  recombination protein F  56.76 
 
 
364 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.26612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  25.75 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  25 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  34.78 
 
 
343 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  25 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  25 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2121  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.47 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>