More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1180 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1180  ABC transporter related  100 
 
 
236 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3333  ABC transporter related  52.19 
 
 
236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  45.3 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0349  ABC transporter related  36.25 
 
 
240 aa  158  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568927 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  42.33 
 
 
369 aa  156  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  36.29 
 
 
247 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  37.19 
 
 
247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 
241 aa  152  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  36.92 
 
 
287 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  33.63 
 
 
332 aa  149  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  40.96 
 
 
240 aa  149  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  35.27 
 
 
245 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
253 aa  148  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  36.78 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  37.9 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  37.9 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  35.54 
 
 
328 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  35.95 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  38.02 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 
312 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  36.16 
 
 
337 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  39.06 
 
 
312 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  33.19 
 
 
292 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  36.32 
 
 
236 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 
312 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  37.04 
 
 
303 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  41.31 
 
 
325 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 
312 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 
312 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
312 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
312 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
312 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  37.93 
 
 
287 aa  144  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
312 aa  144  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0409  ABC transporter related protein  37.08 
 
 
249 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  36.73 
 
 
247 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  39.62 
 
 
315 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.26 
 
 
321 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  38 
 
 
252 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.16 
 
 
316 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
250 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  37.92 
 
 
246 aa  143  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  35.51 
 
 
304 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  36.44 
 
 
236 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  35.19 
 
 
320 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  35.19 
 
 
320 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.38 
 
 
316 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1262  ABC transporter related  35.63 
 
 
245 aa  143  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000313912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  35.44 
 
 
237 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  35.8 
 
 
258 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  35.54 
 
 
247 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
315 aa  142  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
243 aa  142  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1634  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 
257 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00322999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  35.12 
 
 
247 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 
247 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0979  ABC transporter ATP-binding protein EcsA  35.12 
 
 
247 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0958  ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 
247 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1048  ABC transporter ATP-binding protein  35.12 
 
 
247 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1125  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  35.12 
 
 
247 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  35.81 
 
 
306 aa  141  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  36.67 
 
 
288 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  35.12 
 
 
247 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.49 
 
 
256 aa  141  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  33.47 
 
 
253 aa  141  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
311 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4220  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  35.12 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.183421  normal  0.0669124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  36.78 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  33.47 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  37.74 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  35.09 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  34.71 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  36.07 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  35.85 
 
 
344 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  37.67 
 
 
323 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  34.7 
 
 
331 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  34.98 
 
 
307 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  33.89 
 
 
279 aa  139  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2052  ABC transporter related  39.09 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  37.39 
 
 
317 aa  138  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 
241 aa  138  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 
241 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  35.78 
 
 
316 aa  138  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  38.57 
 
 
313 aa  138  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  34.29 
 
 
306 aa  138  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  33.06 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 
244 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  38.78 
 
 
318 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
305 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  35.54 
 
 
241 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  34.05 
 
 
319 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  35.54 
 
 
241 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  36.62 
 
 
310 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  35.54 
 
 
241 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  34.82 
 
 
315 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>