More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1452 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  100 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  58.02 
 
 		 238 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  53.85 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  46.64 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  49.77 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  45.29 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  42.49 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  43.97 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  40.27 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  38.63 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  40.93 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  39.91 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  41.01 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  41.2 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  42.15 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  38.12 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  43.51 
 
 		 258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  37.61 
 
 		 242 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  35.78 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  35.8 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  35.32 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  34.67 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  35.32 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  34.8 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  35.02 
 
 		 241 aa  141  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  34.8 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  34.36 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  37.61 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  34.48 
 
 		 257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  35.47 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  37.63 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  31.52 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  34.55 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  28.79 
 
 		 263 aa  99  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  32.2 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  30.57 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  31.16 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  30.88 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  37.25 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  30.93 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  43.94 
 
 		 94 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  43.94 
 
 		 94 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  43.94 
 
 		 94 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  29.17 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  29.17 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  27.76 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  27.76 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  27.38 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  29.81 
 
 		 517 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  25.57 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  28.71 
 
 		 517 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  30.17 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  28.71 
 
 		 517 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  31.03 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0163  ABC transporter-like  29.95 
 
 		 333 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3634  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.93 
 
 		 549 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0556966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2423  ABC transporter ATP-binding protein  26.19 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0427238  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  26.19 
 
 		 516 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  26.79 
 
 		 543 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  30.43 
 
 		 695 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  29.71 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3639  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.93 
 
 		 549 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1594  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.18 
 
 		 549 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.427378  hitchhiker  0.00203271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3675  ABC transporter-related protein  29.8 
 
 		 454 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3338  ABC transporter related  26.98 
 
 		 347 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  30.18 
 
 		 505 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  28.24 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  26.19 
 
 		 548 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  26.79 
 
 		 548 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1306  ABC transporter related  30.43 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3626  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.1 
 
 		 549 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11637  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter cydD  32.35 
 
 		 527 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107343 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3676  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.1 
 
 		 549 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  26.79 
 
 		 542 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  29.45 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  29.95 
 
 		 500 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3407  ABC transporter ATP-binding/permease  31.1 
 
 		 564 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3369  ABC transporter, ATP-binding protein and permease  31.1 
 
 		 564 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1297  ABC transporter related  24.61 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0328127  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000329  ferric vibriobactin enterobactin transport system ATP-binding protein  23.2 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000365879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  28.23 
 
 		 517 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2059  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.11 
 
 		 694 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190669  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0057  ABC transporter related  30.43 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  26.19 
 
 		 542 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  30.65 
 
 		 503 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2699  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (agrocinopine)  29.5 
 
 		 311 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  27.98 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3496  ABC transporter-like protein  29.38 
 
 		 384 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.41 
 
 		 379 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  22.98 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3723  ABC transporter, ATP-binding protein and permease component  31.18 
 
 		 552 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.772911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  29.34 
 
 		 338 aa  48.9  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4316  ABC transporter related  27.09 
 
 		 528 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293814  normal  0.113849 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  26.76 
 
 		 311 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  27.94 
 
 		 372 aa  48.5  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  30.06 
 
 		 667 aa  48.5  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>