76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1129 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  100 
 
 		 243 aa  503  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  94.07 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  89.41 
 
 		 238 aa  442  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  51.1 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  40.08 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  37.66 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  34.71 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  34.69 
 
 		 250 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  38.46 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  34.89 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  33.05 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  33.05 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  33.47 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  34.87 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  32.52 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  32.92 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  33.33 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  34.41 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  32.92 
 
 		 250 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  33.06 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  36.36 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  32.63 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  33.33 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  35.09 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  34.22 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  36.24 
 
 		 250 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  31.09 
 
 		 269 aa  118  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  37.75 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  30.8 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  30.57 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  30.13 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  30.41 
 
 		 279 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  40 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  28.4 
 
 		 250 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  29.9 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  28.33 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  27.02 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  25.75 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  26.55 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  26.55 
 
 		 344 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  36.67 
 
 		 94 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  31.22 
 
 		 276 aa  45.4  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  36.67 
 
 		 94 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  36.67 
 
 		 94 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1757  ABC transporter related  25.14 
 
 		 538 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0110812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  26.37 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  26.51 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  28.26 
 
 		 570 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  25.64 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  27.54 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  24.54 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  25.13 
 
 		 542 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  27.68 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  24.44 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  27.62 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  26.98 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  24.44 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  27.06 
 
 		 489 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  24.44 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  23.89 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  23.89 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  25.73 
 
 		 330 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  23.16 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  23.89 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  23.89 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  23.89 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1999  ABC transporter related  25.76 
 
 		 571 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0994183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  24.44 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1873  sugar transport ATP-binding protein  29.8 
 
 		 515 aa  42.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  23.33 
 
 		 273 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  20.33 
 
 		 578 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>