More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1757 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013164  Apre_1757  ABC transporter related  100 
 
 
538 aa  1046    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0110812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  22.1 
 
 
617 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  22.22 
 
 
623 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  19.6 
 
 
585 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  21.63 
 
 
603 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  22.2 
 
 
602 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  20.85 
 
 
663 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  24.4 
 
 
594 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0273  ABC transporter related  23.67 
 
 
566 aa  128  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  22.58 
 
 
592 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  21.66 
 
 
606 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  21.86 
 
 
585 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  20 
 
 
619 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  21.01 
 
 
650 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  21.49 
 
 
601 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  20.94 
 
 
598 aa  123  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  21.06 
 
 
601 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  23.13 
 
 
596 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  22.33 
 
 
610 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  23.43 
 
 
626 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  20.33 
 
 
687 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  21.06 
 
 
601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  19.68 
 
 
627 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  19.68 
 
 
627 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  22.95 
 
 
596 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  20.35 
 
 
638 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  20.18 
 
 
611 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  21.47 
 
 
602 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  19.71 
 
 
626 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  21.4 
 
 
596 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  18.34 
 
 
577 aa  120  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  23.01 
 
 
599 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  20.96 
 
 
641 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  21.77 
 
 
622 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  20.34 
 
 
644 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  23.8 
 
 
610 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  22.93 
 
 
770 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  19.42 
 
 
601 aa  118  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  23.7 
 
 
598 aa  118  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  18.79 
 
 
611 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  22.95 
 
 
605 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  22.98 
 
 
767 aa  118  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  21.06 
 
 
741 aa  118  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  23.42 
 
 
618 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  21.14 
 
 
634 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  22.14 
 
 
598 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  21.28 
 
 
677 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.48 
 
 
615 aa  117  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  21.58 
 
 
582 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  20.58 
 
 
622 aa  117  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  19.27 
 
 
660 aa  116  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  23.17 
 
 
586 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  18.32 
 
 
625 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  20.28 
 
 
588 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.45 
 
 
618 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  18.26 
 
 
614 aa  116  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  22.55 
 
 
597 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  20.57 
 
 
594 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  19.33 
 
 
648 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  20.37 
 
 
1024 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0526  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.85 
 
 
592 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000230499  normal  0.803212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  22.75 
 
 
580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  23.76 
 
 
590 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  21.51 
 
 
695 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  22.11 
 
 
600 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  21.46 
 
 
584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  22.24 
 
 
597 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  23.63 
 
 
566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  23.99 
 
 
590 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  21.23 
 
 
616 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  21.98 
 
 
587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  20.86 
 
 
625 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.76 
 
 
586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  22.34 
 
 
590 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.18 
 
 
598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  23 
 
 
598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  22.22 
 
 
598 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  21.44 
 
 
602 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  21.98 
 
 
587 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  20.99 
 
 
598 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  22.11 
 
 
586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  20.54 
 
 
592 aa  114  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  23.3 
 
 
611 aa  114  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  24.19 
 
 
618 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  22.43 
 
 
594 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  20.74 
 
 
634 aa  113  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  23.03 
 
 
598 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  19.34 
 
 
651 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  20.82 
 
 
607 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  21.43 
 
 
592 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  23.03 
 
 
586 aa  113  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  23.4 
 
 
598 aa  113  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  23.61 
 
 
614 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  19.5 
 
 
600 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  21.72 
 
 
575 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  20.29 
 
 
632 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  19.62 
 
 
584 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  21.98 
 
 
587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  22.83 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.14 
 
 
589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>