86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1155 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  100 
 
 		 253 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  60.66 
 
 		 264 aa  307  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  61.98 
 
 		 249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  64 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  57.2 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  56.91 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  55.24 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  59.82 
 
 		 264 aa  278  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  60.09 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  54.58 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  52.85 
 
 		 250 aa  275  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  54.58 
 
 		 241 aa  274  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  52.44 
 
 		 250 aa  272  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  54.17 
 
 		 241 aa  271  7e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  54.17 
 
 		 241 aa  271  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  52.44 
 
 		 250 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  51.63 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  52.44 
 
 		 250 aa  268  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  51.45 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  52.1 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  51.75 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  47.72 
 
 		 242 aa  224  8e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  48.2 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  35.08 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  38.79 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  36.03 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  40.93 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  39.41 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  152  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  34.39 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  38.79 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  34.43 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  33.73 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  33.6 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  35.04 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  35.19 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  34.41 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  32.92 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  31.91 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  50.57 
 
 		 94 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  50.57 
 
 		 94 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  50.57 
 
 		 94 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  29.44 
 
 		 284 aa  88.6  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  26.05 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  27.65 
 
 		 509 aa  49.3  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  28.14 
 
 		 573 aa  48.9  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  25.58 
 
 		 494 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  24.53 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  28.85 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0295  ABC transporter related  25.28 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.852806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  33.67 
 
 		 532 aa  45.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0139  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  28.41 
 
 		 260 aa  45.4  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1529  ABC transporter related  29.44 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  25.84 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  25.84 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  26.56 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0332  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  27.18 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  26.48 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  25.89 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2593  ABC transporter-related protein  29.84 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479665  normal  0.611604 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  37.31 
 
 		 339 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1157  ABC transporter related  24.43 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  27.46 
 
 		 695 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1946  ABC transporter related protein  29.55 
 
 		 744 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  26.55 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1042  ABC transporter ATP-binding protein  24.58 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.309618  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3739  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.83 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  26.19 
 
 		 307 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0315  ATPase  28.67 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.153561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2030  DNA repair protein RecN  48.65 
 
 		 551 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1900  ABC transporter related  29.82 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  22.34 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11331  ABC transporter ATP-binding protein  27.22 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  29.32 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  23.87 
 
 		 602 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  40.3 
 
 		 1151 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  24.86 
 
 		 327 aa  42.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  25.42 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  23.87 
 
 		 602 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2711  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  26.42 
 
 		 581 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0138021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  27.41 
 
 		 261 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1317  hypothetical protein  29.59 
 
 		 388 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.361107  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3801  ABC transporter related  28.8 
 
 		 277 aa  42  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21840  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  23.78 
 
 		 227 aa  42  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908882  normal  0.0444961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1369  ABC transporter related  27.91 
 
 		 240 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141351  normal  0.11041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>