108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4387 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  524  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  57.42 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  58.43 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  38.67 
 
 		 250 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 241 aa  178  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  39.02 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  38.62 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  37.65 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  37.94 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  38.21 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  38.21 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  38.04 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  38.34 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  35.08 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  36.22 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  38.36 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  37.71 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  37.65 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  35.46 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  35.32 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  34.52 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  35.93 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  36.91 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  39.66 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  32.34 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  35.39 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  33.06 
 
 		 238 aa  136  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  33.19 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  32.52 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  32.79 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  35.27 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  37.45 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  35.32 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  36.33 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  35.59 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  35.47 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  27.94 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  33.47 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  29.82 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  39.42 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  34.41 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  42.86 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  42.86 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  42.86 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0823  ABC transporter related  30.98 
 
 		 235 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  29.57 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5239  ABC transporter related  29.41 
 
 		 536 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  27.08 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  21.11 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  26.7 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2114  ABC transporter related protein  26.04 
 
 		 506 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235727  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  28.14 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  22.99 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  37.78 
 
 		 573 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  27.4 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  27.46 
 
 		 457 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  26.37 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  51.28 
 
 		 442 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  25.48 
 
 		 507 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1372  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  28.88 
 
 		 537 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  25.82 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1414  ABC transporter related  26 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0314  ABC transporter related  25.27 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10131  ABC transporter, ATP-binding component  25.99 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0945741 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0697  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  22.12 
 
 		 536 aa  44.3  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  37.78 
 
 		 623 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  26.19 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  27.92 
 
 		 516 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  24.45 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  27.91 
 
 		 579 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0274  ABC transporter related  41.43 
 
 		 532 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  22.57 
 
 		 502 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  25.97 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1501  ABC transporter related  30.81 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.196054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1499  ABC transporter related  24.46 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  25.41 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  26.92 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6451  ABC transporter related  25.15 
 
 		 516 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0328742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  23.08 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0387  ABC transporter for thiamin ATP-binding protein  26.26 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.040787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1454  ABC transporter related  24.46 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  24.02 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  25.57 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  26.4 
 
 		 307 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  30.63 
 
 		 557 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0671  ABC transporter related  26.19 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450645  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24440  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  25.26 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  27.23 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  28.73 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  28.73 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  28.26 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  28.26 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  28.26 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  23.66 
 
 		 588 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  28.26 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  28.26 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4624  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.4 
 
 		 509 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  37.21 
 
 		 441 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0765  ABC transporter  45.45 
 
 		 534 aa  42  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>