95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1101 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  94.07 
 
 		 243 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  88.24 
 
 		 238 aa  443  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  51.53 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  38.11 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  36.1 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  34.15 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  33.47 
 
 		 264 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  34.91 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  36.82 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  34.68 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  33.07 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  34.18 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  33.47 
 
 		 250 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  32.79 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  33.05 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  32.22 
 
 		 249 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  32.91 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  32.91 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  35.22 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  32.92 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  32.62 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  32.74 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  32.09 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  33.47 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  30.71 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  35.53 
 
 		 250 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  36.95 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  29.91 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  32.2 
 
 		 236 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  30.09 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  28.4 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  30.96 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  28.62 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  29.06 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  27.06 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  27.89 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  27.12 
 
 		 282 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  25 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  26.17 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  24.54 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  26.15 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  26.35 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  26.14 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  27.75 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  28.14 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  36.67 
 
 		 94 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1307  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  27.47 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.390273 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  36.67 
 
 		 94 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  28.25 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  36.67 
 
 		 94 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  31.12 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  25.58 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  25.73 
 
 		 330 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  24.02 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  24.02 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  25.58 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  24.58 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  24.02 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  24.58 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  25.58 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  24.02 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  24.58 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  24.58 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  29.55 
 
 		 630 aa  42.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  27.06 
 
 		 489 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.46 
 
 		 616 aa  42.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  24.58 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  25.13 
 
 		 542 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  23.46 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  25.2 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  27.65 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  27.72 
 
 		 570 aa  42.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  23.56 
 
 		 277 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1999  ABC transporter related  26.26 
 
 		 571 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0994183  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  28.49 
 
 		 251 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0115  ABC transporter related  28.49 
 
 		 208 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  25.57 
 
 		 266 aa  42  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4148  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  26.11 
 
 		 286 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  25.47 
 
 		 241 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  28.32 
 
 		 266 aa  42  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1873  sugar transport ATP-binding protein  29.8 
 
 		 515 aa  42  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 		 253 aa  42  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28 
 
 		 284 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  20.54 
 
 		 578 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2972  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 		 515 aa  41.6  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  27.27 
 
 		 245 aa  41.6  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3044  ABC transporter related  30.71 
 
 		 515 aa  41.6  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0523  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 337 aa  41.6  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>