70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3710 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  100 
 
 		 258 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  59.68 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  57.14 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  54.47 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  51.75 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  48.91 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  50.22 
 
 		 250 aa  215  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  48 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  45.75 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  44.94 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  45.87 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  44.13 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  44.53 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  44.63 
 
 		 241 aa  204  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  44.21 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  44.21 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  46.49 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  47.32 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  46.53 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  48 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  41.39 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  47.58 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  45.54 
 
 		 241 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  40.93 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  43.51 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  42.52 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  34.69 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  36.36 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  37.97 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  37.45 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  35.29 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  37.55 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  33.47 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  36.36 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  33.2 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  36.68 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  33.86 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  32.72 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  44.58 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  44.58 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  44.58 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  29.01 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  29 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1331  ABC transporter related  37.42 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.58907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  29.61 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  31.63 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  26.88 
 
 		 511 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  27.93 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  24.07 
 
 		 414 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2303  ABC transporter related protein  29.74 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  hitchhiker  0.00211545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  31.32 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  27.57 
 
 		 504 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2709  excinuclease ABC, A subunit  40 
 
 		 1995 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.350248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3675  ABC transporter-related protein  29.69 
 
 		 454 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  26.09 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  39.29 
 
 		 602 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  39.29 
 
 		 602 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  39.29 
 
 		 602 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  28.95 
 
 		 228 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  28.09 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5326  ABC transporter-related protein  31.28 
 
 		 218 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  29.07 
 
 		 656 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  31.28 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  28.5 
 
 		 502 aa  42.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  28.57 
 
 		 514 aa  42  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00093  MdlB protein  27.75 
 
 		 563 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  27.6 
 
 		 247 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1556  ABC transporter ATP-binding protein  26.26 
 
 		 216 aa  42  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.804949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>