More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1389 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  62.93 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  59.34 
 
 
248 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  65.09 
 
 
246 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  61.47 
 
 
248 aa  255  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3370  ABC transporter-related protein  58.72 
 
 
243 aa  250  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  56.15 
 
 
267 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  58.01 
 
 
243 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  59.64 
 
 
262 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  49.57 
 
 
288 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  50.86 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  49.35 
 
 
265 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 
252 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  43.1 
 
 
280 aa  204  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  50 
 
 
300 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 
254 aa  201  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  41.99 
 
 
254 aa  201  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  41.99 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  44.16 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 
254 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
265 aa  198  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  46.08 
 
 
257 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
296 aa  198  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
265 aa  198  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  45.06 
 
 
296 aa  198  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  47.84 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  44.4 
 
 
298 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  47.11 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  48 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  44.72 
 
 
292 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  46.79 
 
 
273 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  46.55 
 
 
298 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  46.79 
 
 
273 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  46.79 
 
 
273 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  46.79 
 
 
273 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  46.79 
 
 
273 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
280 aa  192  5e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  46.33 
 
 
274 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  45.69 
 
 
296 aa  191  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  47.71 
 
 
299 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  45.87 
 
 
275 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  45.87 
 
 
275 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  44.35 
 
 
275 aa  188  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3453  ABC transporter related  47.41 
 
 
300 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.859541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  45.26 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  42.24 
 
 
296 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  42.24 
 
 
296 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  42.24 
 
 
296 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  50.45 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  50.45 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  44.07 
 
 
259 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  42.42 
 
 
248 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  45.54 
 
 
258 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 
249 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  37.86 
 
 
252 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  46.81 
 
 
260 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 
249 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  45.26 
 
 
251 aa  175  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  41.56 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  40 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  42.86 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  40.52 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  41.07 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0298  ABC transporter related  44.72 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0303285  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
249 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
263 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
261 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  45.18 
 
 
262 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  37.23 
 
 
266 aa  168  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  44.39 
 
 
259 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  37.95 
 
 
273 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 
256 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  39.32 
 
 
263 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
255 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  44.16 
 
 
250 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  41.13 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  41.07 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  42.55 
 
 
255 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  42.42 
 
 
255 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  41.44 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  40.99 
 
 
246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 
237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  43.42 
 
 
263 aa  164  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0281  ABC transporter related  40.55 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00633179  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  34.91 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  38.46 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  41.99 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.87 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  38.96 
 
 
246 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  38.84 
 
 
249 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
255 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1042  ABC transporter related  43.5 
 
 
274 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  40.26 
 
 
286 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  43.69 
 
 
258 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  36.36 
 
 
247 aa  159  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  32.9 
 
 
236 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  36.8 
 
 
248 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>