158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1439 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  100 
 
 		 258 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  57.42 
 
 		 256 aa  298  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  56.47 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  37.8 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  36.91 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  36.91 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  36.78 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  36.48 
 
 		 241 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  36.48 
 
 		 241 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  41.3 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  35.54 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  36.36 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  40.39 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  34.71 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  36.91 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  34.39 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  36.95 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  36.14 
 
 		 250 aa  145  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  33.82 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  36.4 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  36.76 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  34.68 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  32.5 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  34.05 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  34.01 
 
 		 238 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  33.06 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  39.51 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  38.65 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  37.45 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  37.5 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  36.68 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  34.78 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  33.33 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  34.55 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  29.2 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  35.64 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  32.63 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  37.23 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  22.98 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  42.25 
 
 		 94 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  42.25 
 
 		 94 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  42.25 
 
 		 94 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  28.74 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  21.86 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  28.9 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  26.6 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5233  ABC transporter related  31.55 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1514  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.16 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  26.63 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1662  ABC transporter related  26.61 
 
 		 460 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  30.11 
 
 		 625 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.41 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  28.04 
 
 		 372 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  28.04 
 
 		 372 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  27.66 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2348  ABC transporter related  32.35 
 
 		 368 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.917479  normal  0.103865 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  27.14 
 
 		 642 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  27.87 
 
 		 537 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  28.04 
 
 		 372 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0414  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  26.6 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  28.04 
 
 		 372 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0650  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  28.3 
 
 		 364 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  24.46 
 
 		 512 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  27.69 
 
 		 371 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  26.6 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  27.69 
 
 		 371 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  28.96 
 
 		 542 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  25.63 
 
 		 371 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  28.96 
 
 		 537 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1180  ABC transporter related  26.67 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179573  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0200  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.25 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0402446  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  26.98 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  26.67 
 
 		 372 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  27.78 
 
 		 338 aa  45.4  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  25.56 
 
 		 392 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.495762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  26.06 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  26.98 
 
 		 379 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  26.89 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0262  ABC transporter related  30.43 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.888002 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  26.89 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1507  ABC transporter related  25 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  24.21 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  31.46 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.98 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.73 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  23.93 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1103  ABC transporter related  29.35 
 
 		 357 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  30.5 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  26.98 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  26.98 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  26.98 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  26.98 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  26.98 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.65 
 
 		 573 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  27.68 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  26.44 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>