More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5233 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5233  ABC transporter related  100 
 
 
268 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3496  ABC transporter-like protein  47.53 
 
 
384 aa  218  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0342  ABC transporter related protein  47.31 
 
 
332 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2251  ABC transporter related  45.7 
 
 
342 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3089  ABC transporter related  45.56 
 
 
340 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0163  ABC transporter-like  44.14 
 
 
333 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3543  ABC transporter related  48.46 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2112  ABC transporter related  41.41 
 
 
330 aa  195  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00532716  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  35.66 
 
 
375 aa  185  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0279  ABC transporter related  35.55 
 
 
339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343631  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0128  ABC transporter related  34.62 
 
 
376 aa  182  7e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15406  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0646  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.473104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0080  ABC transporter related  34.75 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  40.53 
 
 
412 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1297  ABC transporter related  40.08 
 
 
357 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.934919  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3338  ABC transporter related  39.44 
 
 
347 aa  168  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.68 
 
 
392 aa  168  9e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.495762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24440  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.17 
 
 
259 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1005  ABC transporter related  35.93 
 
 
365 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0737536  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  39.58 
 
 
393 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  29.6 
 
 
256 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 
273 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  30.47 
 
 
273 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  30.47 
 
 
273 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  30.47 
 
 
273 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  34.65 
 
 
257 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12803  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.53 
 
 
263 aa  142  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 
273 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 
273 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  33.86 
 
 
279 aa  141  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0672  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
252 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.164199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  29.92 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  29.1 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  34 
 
 
286 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  26.92 
 
 
259 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  33.61 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  27.31 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  35.11 
 
 
268 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  35.11 
 
 
277 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  31.95 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  35.69 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  31.98 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  32.57 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  28.86 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  33.59 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  28.86 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  32.35 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.35 
 
 
271 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  30.83 
 
 
255 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.61 
 
 
625 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  34.63 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.92 
 
 
490 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  32.54 
 
 
273 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  31.8 
 
 
269 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  33.59 
 
 
278 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  31.3 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  40.1 
 
 
253 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  36.82 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  31.2 
 
 
417 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  33.75 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  28.69 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  37.44 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  34.62 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.78 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  35.56 
 
 
384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3441  ABC transporter related  32.03 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  37.44 
 
 
254 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  36.26 
 
 
287 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  30.54 
 
 
256 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  33.33 
 
 
292 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4439  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 
256 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4784  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 
256 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4658  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.87 
 
 
256 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4278  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  30.54 
 
 
256 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118015  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  33.97 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  33.85 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  36.1 
 
 
260 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  34.85 
 
 
303 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  38.05 
 
 
262 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  33.47 
 
 
273 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  27.97 
 
 
258 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  33.33 
 
 
427 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  35.14 
 
 
278 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  34.44 
 
 
293 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4289  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  29.71 
 
 
256 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  36.56 
 
 
254 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  33.49 
 
 
250 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  32.22 
 
 
269 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3325  ABC transporter-related protein  40.29 
 
 
257 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946255  normal  0.977601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  32.22 
 
 
269 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.4 
 
 
272 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  28.89 
 
 
256 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  34.73 
 
 
280 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  35.07 
 
 
296 aa  122  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>