More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3496 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3496  ABC transporter-like protein  100 
 
 
384 aa  742    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0342  ABC transporter related protein  64.95 
 
 
332 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3543  ABC transporter related  62.69 
 
 
271 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3089  ABC transporter related  50.49 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2112  ABC transporter related  44.56 
 
 
330 aa  249  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00532716  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0163  ABC transporter-like  45.3 
 
 
333 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2251  ABC transporter related  52.1 
 
 
342 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0279  ABC transporter related  41.36 
 
 
339 aa  239  8e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343631  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1297  ABC transporter related  44.08 
 
 
357 aa  222  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.934919  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5233  ABC transporter related  47.53 
 
 
268 aa  212  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1005  ABC transporter related  40.26 
 
 
365 aa  210  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0737536  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0646  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
333 aa  205  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.473104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3338  ABC transporter related  41.37 
 
 
347 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  41.53 
 
 
412 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  46.09 
 
 
393 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  38.8 
 
 
375 aa  192  7e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.84 
 
 
392 aa  190  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.495762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12803  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.64 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0080  ABC transporter related  37.45 
 
 
258 aa  182  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0128  ABC transporter related  37.29 
 
 
376 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15406  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24440  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.68 
 
 
259 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0672  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 
252 aa  167  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.164199 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  36.21 
 
 
455 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  38.25 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  41.89 
 
 
259 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  36.84 
 
 
268 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  37.45 
 
 
275 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
270 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  39.3 
 
 
281 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
270 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
270 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
270 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 
270 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 
270 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
270 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  37.34 
 
 
270 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
270 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
270 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2442  ABC transporter related  39.83 
 
 
316 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0120547 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  36.51 
 
 
270 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  38.1 
 
 
274 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  38.1 
 
 
274 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.42 
 
 
271 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 
265 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2191  ABC transporter related  37.7 
 
 
313 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  38.91 
 
 
283 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  38.98 
 
 
280 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  38.21 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
293 aa  153  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  34.29 
 
 
265 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  39.27 
 
 
282 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  39.27 
 
 
282 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  34.29 
 
 
265 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  38.01 
 
 
417 aa  152  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  38.55 
 
 
283 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  39.27 
 
 
282 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 
282 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  38.17 
 
 
274 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  37.85 
 
 
269 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  39.61 
 
 
277 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  41.53 
 
 
260 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  39.75 
 
 
419 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  37.34 
 
 
263 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  32.3 
 
 
259 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2937  ABC transporter related protein  35.75 
 
 
284 aa  150  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  38.08 
 
 
285 aa  149  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  35.19 
 
 
273 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
257 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  37.07 
 
 
275 aa  149  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  32.3 
 
 
259 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  37.97 
 
 
264 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  32.49 
 
 
258 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  38.94 
 
 
267 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 
296 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
296 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  40.65 
 
 
271 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  40.85 
 
 
296 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
273 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
273 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
273 aa  147  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 
296 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
296 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  44.5 
 
 
271 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
296 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
263 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  41.22 
 
 
284 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  40.56 
 
 
424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.79 
 
 
285 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
273 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
273 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1526  ABC transporter related  35.29 
 
 
283 aa  146  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  36.21 
 
 
264 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  42.67 
 
 
274 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  37.13 
 
 
268 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  35.92 
 
 
271 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 
271 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  38.79 
 
 
273 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  35.92 
 
 
271 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>