More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3543 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3543  ABC transporter related  100 
 
 		 271 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3496  ABC transporter-like protein  62.69 
 
 		 384 aa  288  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0342  ABC transporter related protein  63.29 
 
 		 332 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0163  ABC transporter-like  54.25 
 
 		 333 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3089  ABC transporter related  57.77 
 
 		 340 aa  254  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2251  ABC transporter related  57.77 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2112  ABC transporter related  48.61 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00532716  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0279  ABC transporter related  43.08 
 
 		 339 aa  226  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343631  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  39 
 
 		 375 aa  208  7e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1005  ABC transporter related  44.04 
 
 		 365 aa  206  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0737536  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1297  ABC transporter related  44.16 
 
 		 357 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.934919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5233  ABC transporter related  48.46 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3338  ABC transporter related  45.59 
 
 		 347 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0646  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 333 aa  201  9e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.473104 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0128  ABC transporter related  36.5 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  45.12 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12803  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.1 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0672  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.164199 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.44 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.495762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0080  ABC transporter related  34.96 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24440  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.43 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  39.19 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.02 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.87 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  39.64 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  38.89 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  41.04 
 
 		 276 aa  152  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  40.44 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  36.78 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.79 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  41.7 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  38.33 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  31.15 
 
 		 273 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  37 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  40 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  36.02 
 
 		 455 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  41.03 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  41.5 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  37.2 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  42.75 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.15 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  37.39 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  37.84 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.15 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  38.26 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.15 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.74 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.74 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  38.78 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  34.87 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  39.09 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  36.32 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  40.09 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  34.57 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  36.21 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  30.74 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  30.74 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.74 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36.56 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  38.56 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0032  ABC transporter related  42.68 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.74 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  42.6 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  41.91 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.35 
 
 		 625 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  39.64 
 
 		 252 aa  142  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.161407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  36.36 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  34.57 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  41.44 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  36.36 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  37.55 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  36.44 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  27.65 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  33.07 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  38.2 
 
 		 419 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>