More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2251 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2251  ABC transporter related  100 
 
 
342 aa  676    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3089  ABC transporter related  75.52 
 
 
340 aa  511  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0163  ABC transporter-like  56.33 
 
 
333 aa  371  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1297  ABC transporter related  52.12 
 
 
357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.934919  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2112  ABC transporter related  48.36 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00532716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1005  ABC transporter related  47.78 
 
 
365 aa  299  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0737536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0279  ABC transporter related  47.48 
 
 
339 aa  295  9e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343631  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3338  ABC transporter related  52.46 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0646  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.09 
 
 
333 aa  258  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.473104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0342  ABC transporter related protein  52.28 
 
 
332 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3496  ABC transporter-like protein  52.1 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3543  ABC transporter related  57.77 
 
 
271 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0080  ABC transporter related  42.13 
 
 
258 aa  225  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  39.45 
 
 
375 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0128  ABC transporter related  38.28 
 
 
376 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12803  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.21 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5233  ABC transporter related  45.7 
 
 
268 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.51 
 
 
392 aa  185  8e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.495762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  40.98 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  43.04 
 
 
276 aa  180  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0672  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
252 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.164199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  41.73 
 
 
284 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
257 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24440  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.57 
 
 
259 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  37.39 
 
 
268 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 
250 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  39.26 
 
 
285 aa  165  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  37.6 
 
 
286 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
262 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
256 aa  162  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  36.21 
 
 
418 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
272 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 
272 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
272 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 
272 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 
272 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  35.63 
 
 
272 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 
272 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  42.36 
 
 
260 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  31.95 
 
 
273 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 
272 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  38.08 
 
 
269 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  40.43 
 
 
274 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 
267 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.54 
 
 
273 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.54 
 
 
273 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  40.38 
 
 
250 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.54 
 
 
273 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.33 
 
 
268 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  37.66 
 
 
269 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 
273 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 
273 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  41.42 
 
 
277 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  41.42 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
278 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
271 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  40.08 
 
 
267 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 
273 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4448  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
272 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
264 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
264 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4500  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 
272 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 
273 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 
273 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 
264 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  34.72 
 
 
265 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 
273 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  36.89 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  35.77 
 
 
275 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
264 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
264 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  36.89 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  41.78 
 
 
424 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  39.55 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  37.05 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  36.51 
 
 
269 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  32.92 
 
 
271 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 
266 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  38.49 
 
 
263 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
255 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  30.43 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.48 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  35.43 
 
 
455 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  36.93 
 
 
268 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  33.47 
 
 
254 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  39.04 
 
 
260 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38.11 
 
 
269 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  36.93 
 
 
281 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 
273 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  38.91 
 
 
260 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  38 
 
 
255 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  38.33 
 
 
259 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  33.58 
 
 
265 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>