132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3332 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  100 
 
 		 249 aa  513  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  72.98 
 
 		 264 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  63.86 
 
 		 249 aa  353  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  61.98 
 
 		 250 aa  327  8e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  60.25 
 
 		 250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  61.32 
 
 		 250 aa  324  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  59.44 
 
 		 250 aa  315  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  59.44 
 
 		 250 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  57.83 
 
 		 250 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  58.06 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  58.06 
 
 		 250 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  64 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  56.85 
 
 		 241 aa  299  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  56.85 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  56.68 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  56.05 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  56.05 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  64.68 
 
 		 246 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  51.61 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  56.18 
 
 		 252 aa  271  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  56.64 
 
 		 264 aa  271  9e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  54.47 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  50.2 
 
 		 242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  46.32 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  38.18 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  37.04 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  41.2 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  41.96 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  37.23 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  36.91 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  40.81 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  36.76 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  33.05 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  34.66 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  39.5 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  32.22 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  34.58 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  36.4 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  38.33 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  35.04 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  56.79 
 
 		 94 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  56.79 
 
 		 94 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  56.79 
 
 		 94 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  27.61 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  26.82 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1493  ATPase  28.44 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01991  ABC transporter ATP-binding protein  27.98 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0315  ATPase  30.72 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.153561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  23.56 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  30.46 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0805  ABC transporter related  26.09 
 
 		 208 aa  48.9  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  27.13 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  22.92 
 
 		 509 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29271  ABC transporter ATP-binding protein  25.99 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  25.22 
 
 		 510 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01421  ABC transporter ATP-binding protein  26.46 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8310  ABC transporter related  27.35 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.575602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  27.18 
 
 		 477 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  41.79 
 
 		 504 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00170  putative ATP-binding protein involved in cell division  24.23 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  27.23 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  24.34 
 
 		 245 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2038  ABC transporter ATP-binding protein  27.41 
 
 		 287 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6748  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  29.55 
 
 		 256 aa  45.4  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  23.01 
 
 		 272 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  25.64 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  27.59 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 		 515 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  28.8 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  25.47 
 
 		 510 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  26.55 
 
 		 505 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  24.78 
 
 		 510 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  28.8 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  24.02 
 
 		 510 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  24.02 
 
 		 508 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  24.02 
 
 		 510 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  24.02 
 
 		 510 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2030  DNA repair protein RecN  43.1 
 
 		 551 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  24.02 
 
 		 510 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  25.57 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2775  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  25.74 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  36.78 
 
 		 501 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  24.02 
 
 		 510 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  24.02 
 
 		 510 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26461  ABC transporter ATP-binding protein  24.89 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1501  ABC transporter related  30.97 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.196054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  26.74 
 
 		 494 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  28.72 
 
 		 509 aa  43.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  26.96 
 
 		 537 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  26.29 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2844  ABC transporter ATP-binding protein  28.77 
 
 		 753 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  26.15 
 
 		 647 aa  43.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  47.37 
 
 		 1063 aa  43.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  25.62 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1999  ABC transporter related  29.17 
 
 		 571 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0994183  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1544  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.21 
 
 		 467 aa  42.7  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0709  ABC transporter related  25.35 
 
 		 557 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0725  ABC transporter related  25.35 
 
 		 557 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  31.89 
 
 		 726 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1831  vitamin B12-transporter ATPase  28.9 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>