110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0046 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  496  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  53.88 
 
 
250 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  54.11 
 
 
264 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  50.2 
 
 
241 aa  232  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  49.01 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  50.2 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  52.91 
 
 
241 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  49.8 
 
 
241 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  49.8 
 
 
241 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  51.07 
 
 
250 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
241 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  48.62 
 
 
250 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  48.81 
 
 
250 aa  228  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  51.77 
 
 
246 aa  228  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  50.86 
 
 
250 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  55.56 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  51.29 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  47.72 
 
 
253 aa  224  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  51.44 
 
 
249 aa  221  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  48.78 
 
 
242 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  52.4 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  45.42 
 
 
252 aa  204  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  46.53 
 
 
258 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  45.85 
 
 
236 aa  180  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  41.96 
 
 
238 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  37.65 
 
 
256 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  37.79 
 
 
234 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  34.34 
 
 
269 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  36.4 
 
 
258 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  37.61 
 
 
236 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  36.79 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  36.86 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  34.18 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  34.03 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  34.87 
 
 
243 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  35.9 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  34.69 
 
 
250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  38.25 
 
 
241 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  34.05 
 
 
247 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  35.78 
 
 
244 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  47.62 
 
 
94 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  47.62 
 
 
94 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  47.62 
 
 
94 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  39.33 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  40.96 
 
 
285 aa  65.1  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0307  ABC transporter related  26.4 
 
 
293 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.26 
 
 
573 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  26.88 
 
 
253 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  26.32 
 
 
233 aa  48.5  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.09 
 
 
496 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.09 
 
 
496 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2400  ABC transporter related  27.67 
 
 
358 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511263  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.36 
 
 
497 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1710  ABC transporter related  28.57 
 
 
236 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  27.59 
 
 
260 aa  46.2  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  28.76 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  25.54 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  38.36 
 
 
576 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 
265 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  32.73 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  25 
 
 
276 aa  45.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  28.73 
 
 
232 aa  45.4  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  28.32 
 
 
305 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0212  ABC transporter related  25.75 
 
 
496 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  25.89 
 
 
540 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 
416 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  31.33 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  26.32 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0435  ABC transporter related  26.83 
 
 
332 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  25.89 
 
 
540 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  31.71 
 
 
369 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  27.38 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  28.32 
 
 
305 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3574  ABC transporter related  30.59 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034962  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  26.51 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  30.36 
 
 
843 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  23.08 
 
 
564 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  28.37 
 
 
305 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  23.87 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0805  ABC transporter related  26.83 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
282 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28 
 
 
490 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  28.37 
 
 
305 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  24.05 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0015  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  27.49 
 
 
365 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  28.92 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  25.73 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  28.25 
 
 
504 aa  43.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  27.37 
 
 
529 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  30.09 
 
 
556 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  27.03 
 
 
268 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  54.05 
 
 
375 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  28.8 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  28.37 
 
 
305 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  28.82 
 
 
367 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 
275 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1157  ABC transporter related  25.47 
 
 
237 aa  42  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  24 
 
 
278 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.67 
 
 
616 aa  42  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  25.29 
 
 
517 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>