More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0896 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  100 
 
 		 250 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  89.8 
 
 		 247 aa  440  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  53.44 
 
 		 279 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  46.96 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  47.81 
 
 		 241 aa  188  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  46.64 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  42.55 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  40.4 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  35.53 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  36.86 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  34.65 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  33.73 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  38.37 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  34.21 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  34.21 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  34.15 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  34.6 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  37.76 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  34.18 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  34.18 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  34.76 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  33.76 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  39.5 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  34.63 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  34.1 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  33.76 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  37.97 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  34.69 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  36.33 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  36.77 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  30.45 
 
 		 269 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  37.45 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  35.02 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  28.37 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  28.4 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  29.24 
 
 		 234 aa  88.6  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  28.4 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  21.83 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  34.02 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  39.18 
 
 		 94 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  39.18 
 
 		 94 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  39.18 
 
 		 94 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.27 
 
 		 664 aa  55.5  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  28.42 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  29.9 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  29.44 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  29.84 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  26.59 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  28.76 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  26.88 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  29.31 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  28 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5078  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  28.38 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  28.24 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0800  ABC transporter related  26.16 
 
 		 509 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0302  ABC transporter related  25.98 
 
 		 289 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.353598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  26.9 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  28.57 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2014  ABC transporter related  30.11 
 
 		 534 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0103436  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4810  ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5175  ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  29.28 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  27.5 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  28.74 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  28.74 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  28.37 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4652  ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  28.18 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  33.14 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5049  ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5080  ABC transporter, ATP-binding protein  26.37 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1577  histidine kinase  29.28 
 
 		 750 aa  49.3  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.348656  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1719  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.49 
 
 		 318 aa  48.9  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5022  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  28.74 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  27.43 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  28.19 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  25.95 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  28.31 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  28.81 
 
 		 313 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  27.32 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  26.46 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  28.98 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  27.86 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4528  ABC transporter related  28.74 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  26.35 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5083  ABC transporter, ATP-binding protein  28.86 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.73 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  29.55 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  30.26 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  26.07 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5072  ABC transporter related  28.74 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1954  ABC transporter related  28.82 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  29.76 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1175  ABC transporter related  31.02 
 
 		 469 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.902135  normal  0.0612895 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  26.14 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>