164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3216 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  100 
 
 
252 aa  502  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  56.18 
 
 
249 aa  271  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  55.36 
 
 
250 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  59.68 
 
 
258 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  52.19 
 
 
264 aa  255  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  51.54 
 
 
249 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  46.25 
 
 
250 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 
250 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  52.1 
 
 
253 aa  239  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  46.25 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  46.25 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 
241 aa  236  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  45.82 
 
 
241 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  50.66 
 
 
250 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  45.06 
 
 
250 aa  234  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  44.62 
 
 
241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  44.62 
 
 
241 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  44.62 
 
 
241 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  48.02 
 
 
250 aa  224  9e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  53.54 
 
 
246 aa  220  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  43.85 
 
 
264 aa  218  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  45.42 
 
 
242 aa  204  8e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  38.21 
 
 
242 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  43.05 
 
 
236 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  43.97 
 
 
236 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  43.91 
 
 
238 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  43.75 
 
 
241 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  40.4 
 
 
250 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  42.17 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  35.14 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  39.66 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  39.26 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  38.12 
 
 
279 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  33.07 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  33.33 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  33.09 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  38.65 
 
 
258 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  32.28 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  35.9 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  33.63 
 
 
234 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  30.67 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  23.75 
 
 
284 aa  62.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  50.85 
 
 
94 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  50.85 
 
 
94 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  50.85 
 
 
94 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  27.62 
 
 
528 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  28.38 
 
 
511 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.86 
 
 
511 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  28.18 
 
 
537 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  29.02 
 
 
511 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2711  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  38.82 
 
 
581 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0138021  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  29.3 
 
 
262 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 
262 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 
262 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  27.59 
 
 
516 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  31 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0212  ABC transporter related  25.86 
 
 
496 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  31 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  27.49 
 
 
501 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1874  ABC transporter related protein  28.64 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0805  ABC transporter related  24.43 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  28.36 
 
 
504 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1767  ABC transporter related  28.65 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  28.91 
 
 
255 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5737  ABC transporter related  27.72 
 
 
211 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1404  heme exporter protein CcmA  30.98 
 
 
213 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  30.46 
 
 
322 aa  47  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  29.02 
 
 
267 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  29.41 
 
 
516 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  25.76 
 
 
1462 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  29.8 
 
 
503 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  29.41 
 
 
516 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  30.15 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  30.5 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  29.28 
 
 
516 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  30.69 
 
 
499 aa  45.4  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  30.32 
 
 
517 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  28.96 
 
 
517 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  22.01 
 
 
505 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  28.93 
 
 
501 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  30.32 
 
 
517 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  30.32 
 
 
517 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  28.57 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1890  tungsten ABC transporter, ATP-binding protein, putative  23.98 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  28.32 
 
 
490 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  28.57 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3589  ABC transporter related protein  27.5 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  29.41 
 
 
516 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  29.65 
 
 
501 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.06 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5111  ABC transporter related  30.3 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.48212  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  29.65 
 
 
501 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>