69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4729 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  100 
 
 
269 aa  547  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  38.77 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  36.8 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  40.94 
 
 
264 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  38.18 
 
 
249 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  38.82 
 
 
249 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  39.31 
 
 
250 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  37.94 
 
 
250 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  36.06 
 
 
250 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  36.51 
 
 
264 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  35.69 
 
 
250 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  34.34 
 
 
242 aa  149  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  35.69 
 
 
250 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  37.17 
 
 
250 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  35.69 
 
 
241 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 
241 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  34.94 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  35.14 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  33.82 
 
 
258 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  35.32 
 
 
241 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  35.32 
 
 
241 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  35.32 
 
 
241 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  34.43 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  32.71 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  37.31 
 
 
246 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  32.34 
 
 
256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  32.83 
 
 
238 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  34.07 
 
 
257 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  30.45 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  35.29 
 
 
258 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  31 
 
 
238 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  31.09 
 
 
243 aa  118  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  30.71 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  29.7 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  32.8 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  31.52 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  29.75 
 
 
234 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  31.6 
 
 
244 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  32.82 
 
 
236 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  29.47 
 
 
279 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  27.14 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  25.4 
 
 
284 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  28.32 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0295  ABC transporter related  26.89 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.852806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2465  ABC transporter related protein  30.35 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  25.44 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  22.62 
 
 
236 aa  47  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  40 
 
 
378 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30470  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  30.96 
 
 
282 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.855902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  26.75 
 
 
233 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  26.03 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  25.33 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  35.62 
 
 
427 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2717  ABC transporter related  29.21 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2400  cell division ATP-binding protein FtsE  25.62 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0253166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0414  ABC transporter related protein  30 
 
 
283 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  27.44 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  27.72 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3056  ABC transporter related protein  27.69 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  30.69 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 
223 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  26.54 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  25.85 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  29.47 
 
 
223 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0302  ABC transporter related  26.61 
 
 
289 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.353598 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  28.72 
 
 
250 aa  42.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  27.13 
 
 
251 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0374  ABC transporter related  27.65 
 
 
232 aa  42.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.13034  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  37.68 
 
 
573 aa  42  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>