95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4702 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  100 
 
 		 257 aa  524  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  58.43 
 
 		 256 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  56.47 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  38.68 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  40.6 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  40.33 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  41.08 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  39.74 
 
 		 241 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  39.92 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  40.33 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  39.32 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  39.32 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  38.21 
 
 		 264 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  39.57 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  38.64 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  36.68 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  37.28 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  36.32 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  37.34 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  36.79 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  36.11 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  33.87 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  34.96 
 
 		 238 aa  138  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  36.65 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  34.07 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  34.93 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  35.24 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  36.61 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  34.75 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  37.45 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  38.83 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  37.44 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  34.9 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  36.07 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  36.79 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  33.46 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  34.55 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  28.45 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  21.86 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  45.71 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  45.71 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  45.71 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  25.56 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  25.71 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  25.44 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  26.88 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  24.77 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  44.44 
 
 		 623 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  22.73 
 
 		 570 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  22.73 
 
 		 570 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  26.02 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  26.38 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  31.31 
 
 		 595 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  28.18 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  27.08 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  41.54 
 
 		 634 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  35.29 
 
 		 452 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  40 
 
 		 573 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  27.49 
 
 		 534 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1710  ABC transporter related  24.54 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  26.99 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  25 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  24.26 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1514  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.59 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0302  ABC transporter related  23.83 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.353598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  26.29 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  25.62 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1967  ABC transporter related protein  27.72 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.234063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  25.54 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  25.67 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3743  hypothetical protein  37.7 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00892943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  22.16 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  26.84 
 
 		 514 aa  42.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  26.29 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  33.93 
 
 		 647 aa  42.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  34.04 
 
 		 416 aa  42.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1467  ABC transporter related protein  25.34 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  24.44 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  25.15 
 
 		 313 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  25.25 
 
 		 488 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  27.07 
 
 		 557 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  25.25 
 
 		 488 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  29.81 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  22.94 
 
 		 371 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  25.15 
 
 		 313 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  37.84 
 
 		 708 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  28.21 
 
 		 299 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  25.23 
 
 		 247 aa  42  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1037  ABC transporter related  30.21 
 
 		 332 aa  42  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.51 
 
 		 608 aa  42  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  30.3 
 
 		 255 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  26.57 
 
 		 253 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>