More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1037 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1037  ABC transporter related  100 
 
 
332 aa  670    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0446  ABC transporter related  60.06 
 
 
333 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0346  ABC transporter related  62.19 
 
 
337 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00397781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1988  ABC transporter related  59.88 
 
 
331 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3326  ABC transporter related  57.88 
 
 
345 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0475  ABC transporter, ATP-binding protein  56.27 
 
 
351 aa  355  3.9999999999999996e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1976  ABC transporter related protein  54.19 
 
 
333 aa  349  3e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2106  ABC-type transport system, ATPase component  53.47 
 
 
351 aa  348  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2267  ABC transporter, ATP-binding protein  53.73 
 
 
336 aa  348  9e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0800991  normal  0.721323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02410  ABC transporter, ATP-binding component  54.18 
 
 
335 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0985193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2094  ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 
338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4261  ABC transporter related  53.54 
 
 
343 aa  328  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1674  ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 
337 aa  325  5e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.826936  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00480  ABC transporter, ATP binding component  50.94 
 
 
327 aa  295  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1400  ABC transporter related  53.41 
 
 
263 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.457533  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2259  ABC transporter related  51.21 
 
 
274 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1284  ABC transporter related  51 
 
 
262 aa  259  6e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1455  ABC transporter, ATPase subunit  53.44 
 
 
254 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2371  ABC transporter related  60.91 
 
 
228 aa  257  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.621592  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0154  ABC transporter related  54.62 
 
 
260 aa  256  4e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1276  ABC transporter related  52.61 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.698379  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0680  ABC transporter related  52.61 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0681  ABC transporter related  52.44 
 
 
253 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1683  SN-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein (UgpC)  44.53 
 
 
258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0499  hypothetical protein  41.41 
 
 
263 aa  208  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1066  ABC transporter component  43.78 
 
 
261 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2609  ABC transporter related  46.4 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00433881  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2738  ABC transporter related  37.6 
 
 
260 aa  193  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2981  ABC transporter related  38.65 
 
 
273 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1794  ABC transporter related  40.16 
 
 
257 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0107  ABC transporter-related protein  37.35 
 
 
259 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2113  ABC transporter related  38.15 
 
 
270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  29.32 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  33.17 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1090  ABC transporter related  30.14 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  33.5 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  29.95 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  31.05 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  32.54 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  29.74 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  31.1 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  31.1 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  28.77 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  28.33 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2702  ABC transporter related  31.31 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2646  ABC transporter related  31.31 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  28.91 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0122  ABC transporter related  30.28 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.102502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3406  ABC transporter ATP-binding protein  28.91 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0509815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3142  ABC transporter, ATP-binding protein  28.11 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00969837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2848  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  29.82 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  28.23 
 
 
235 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  30.62 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3052  ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  31.94 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  32.2 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  31.86 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  29.61 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  27.57 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  27.8 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  31.91 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  28.64 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  29.21 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  27.71 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  30.5 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  27.11 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  24.78 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  31.19 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  26.87 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  28.57 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  28.16 
 
 
376 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  28.16 
 
 
376 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0629  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.64 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  28.3 
 
 
235 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  30.28 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  28.64 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  28.23 
 
 
234 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  28.5 
 
 
340 aa  65.9  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  27.4 
 
 
238 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  28.64 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  28.17 
 
 
237 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  28.16 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  30.43 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3407  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.32 
 
 
600 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.830424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  28.64 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  30.74 
 
 
233 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  29.68 
 
 
368 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 
250 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>