More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00480 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_00480  ABC transporter, ATP binding component  100 
 
 		 327 aa  654    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2106  ABC-type transport system, ATPase component  53.61 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1037  ABC transporter related  50.95 
 
 		 332 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02410  ABC transporter, ATP-binding component  53.4 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0985193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1674  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.826936  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3326  ABC transporter related  48.25 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2267  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 336 aa  278  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0800991  normal  0.721323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1988  ABC transporter related  47.78 
 
 		 331 aa  277  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0346  ABC transporter related  46.67 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00397781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2094  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185149  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1976  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 333 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0475  ABC transporter, ATP-binding protein  54.29 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0446  ABC transporter related  53.82 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4261  ABC transporter related  49.44 
 
 		 343 aa  261  8e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347781  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2259  ABC transporter related  55.42 
 
 		 274 aa  245  8e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0681  ABC transporter related  51.43 
 
 		 253 aa  242  7e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2371  ABC transporter related  56.16 
 
 		 228 aa  235  7e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.621592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1400  ABC transporter related  47.54 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.457533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1284  ABC transporter related  44.94 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1455  ABC transporter, ATPase subunit  48.98 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1276  ABC transporter related  47.13 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.698379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0680  ABC transporter related  47.13 
 
 		 263 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0154  ABC transporter related  44.53 
 
 		 260 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1683  SN-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein (UgpC)  44.94 
 
 		 258 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0499  hypothetical protein  41.11 
 
 		 263 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1066  ABC transporter component  45.56 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0107  ABC transporter-related protein  42 
 
 		 259 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2113  ABC transporter related  42.51 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2738  ABC transporter related  41.63 
 
 		 260 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1794  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2981  ABC transporter related  39.29 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2609  ABC transporter related  47.06 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00433881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  32.14 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  31.7 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  30.67 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  30.48 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  32.57 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  31.07 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  27.05 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  31.55 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  35.38 
 
 		 269 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  30.04 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  27.88 
 
 		 234 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  31.58 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  29.33 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  31.63 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  28.66 
 
 		 720 aa  66.2  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  28.22 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  28.71 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  27.8 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  29.63 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1234  cell division ATP-binding protein FtsE  27.46 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.21 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  31.19 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  28 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  31.71 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  29.68 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  33.95 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.14 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  25.96 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  28.57 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  31.16 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  30.88 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  27.49 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  27.75 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.57 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  28.51 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  28.27 
 
 		 731 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2678  ABC transporter related protein  32.24 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  27.83 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1805  transport ATP-binding protein CydC  28.17 
 
 		 571 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  25 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1945  transport ATP-binding protein CydC  28.17 
 
 		 571 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  25 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  31.88 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  26.61 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.57 
 
 		 502 aa  62.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  29.53 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  25 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  33.81 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1980  transport ATP-binding protein CydC  28.17 
 
 		 571 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11013e-20 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  30.63 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  30.43 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3052  ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  28.06 
 
 		 720 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  30.52 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  30.85 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  27.54 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  29.09 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.73 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  29.52 
 
 		 230 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2603  ABC transporter related  30.87 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  26.99 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  29.41 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  30.8 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>