More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2106 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2106  ABC-type transport system, ATPase component  100 
 
 		 351 aa  703    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0446  ABC transporter related  53.58 
 
 		 333 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1037  ABC transporter related  54.78 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3326  ABC transporter related  53.07 
 
 		 345 aa  340  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2094  ABC transporter, ATP-binding protein  51.96 
 
 		 338 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0346  ABC transporter related  51.88 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00397781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1988  ABC transporter related  50.15 
 
 		 331 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0475  ABC transporter, ATP-binding protein  50.15 
 
 		 351 aa  328  7e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1976  ABC transporter related protein  48.34 
 
 		 333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02410  ABC transporter, ATP-binding component  52.12 
 
 		 335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0985193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2267  ABC transporter, ATP-binding protein  47.59 
 
 		 336 aa  322  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0800991  normal  0.721323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1674  ABC transporter, ATP-binding protein  47.9 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.826936  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00480  ABC transporter, ATP binding component  53.61 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4261  ABC transporter related  46.79 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347781  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1284  ABC transporter related  48.81 
 
 		 262 aa  257  3e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1400  ABC transporter related  48.83 
 
 		 263 aa  252  7e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.457533  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2259  ABC transporter related  51 
 
 		 274 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2371  ABC transporter related  58.37 
 
 		 228 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.621592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0154  ABC transporter related  48.81 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1455  ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 		 254 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0680  ABC transporter related  48.44 
 
 		 263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1276  ABC transporter related  48.44 
 
 		 263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.698379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0681  ABC transporter related  51.01 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1683  SN-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein (UgpC)  48.4 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0499  hypothetical protein  38 
 
 		 263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2609  ABC transporter related  43.37 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00433881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1066  ABC transporter component  41.83 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1794  ABC transporter related  38 
 
 		 257 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2113  ABC transporter related  36.65 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0107  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2981  ABC transporter related  34.57 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2738  ABC transporter related  36.19 
 
 		 260 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  27.78 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  30.04 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  26.99 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  27.43 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  27.43 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  26.99 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  25.89 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.88 
 
 		 799 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 		 256 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.16 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  30.12 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  25.71 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  25.66 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28040  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  29.47 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.539146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3052  ABC transporter, ATP-binding protein  27.69 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.7 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  27.27 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  27.69 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  26.55 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  25.93 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3406  ABC transporter ATP-binding protein  27.69 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0509815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  31.43 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4964  bacitracin export ATP-binding protein BceA  27.19 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  27.67 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1465  ABC transporter, transmembrane region, type 1  27.4 
 
 		 557 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  26.21 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  25.79 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  25.79 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  26.21 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  25.73 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3142  ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00969837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4557  ABC transporter, ATP-binding protein  28.51 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  25.73 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  25.66 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  27.8 
 
 		 226 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.16 
 
 		 568 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.52 
 
 		 594 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  26.21 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  26.21 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  26.21 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  26.21 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  26.21 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  34.91 
 
 		 731 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3167  ABC transporter related protein  25.12 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.351033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.86 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  26.07 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0428  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.76 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00313991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3407  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.26 
 
 		 600 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830424 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  27.27 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4950  bacitracin export ATP-binding protein BceA  29.19 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0904  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  28.11 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  31.6 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.35 
 
 		 665 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5201  bacitracin export ATP-binding protein BceA  27.4 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  29.03 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  27.09 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  29.81 
 
 		 641 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0768  response regulatory protein  30.62 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  28.57 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  27.06 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  26.07 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1010  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.55 
 
 		 629 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0657  ABC transporter ATP-binding protein  27.78 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  25.12 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  29.47 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>