More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0680 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0680  ABC transporter related  100 
 
 
263 aa  527  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1276  ABC transporter related  98.1 
 
 
263 aa  521  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.698379  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1400  ABC transporter related  97.72 
 
 
263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.457533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1284  ABC transporter related  85.38 
 
 
262 aa  454  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0154  ABC transporter related  83.53 
 
 
260 aa  411  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1455  ABC transporter, ATPase subunit  63.52 
 
 
254 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.289991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0681  ABC transporter related  63.01 
 
 
253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1037  ABC transporter related  52.61 
 
 
332 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1674  ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 
337 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.826936  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0475  ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02410  ABC transporter, ATP-binding component  49.8 
 
 
335 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0985193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2106  ABC-type transport system, ATPase component  48.44 
 
 
351 aa  250  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1988  ABC transporter related  52.23 
 
 
331 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2267  ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 
336 aa  246  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0800991  normal  0.721323 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1976  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
333 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1683  SN-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein (UgpC)  51.79 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3326  ABC transporter related  50.2 
 
 
345 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0346  ABC transporter related  49.4 
 
 
337 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00397781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2094  ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 
338 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185149  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0499  hypothetical protein  45.16 
 
 
263 aa  236  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4261  ABC transporter related  48.4 
 
 
343 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0446  ABC transporter related  45.78 
 
 
333 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0107  ABC transporter-related protein  43.9 
 
 
259 aa  229  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2113  ABC transporter related  43.43 
 
 
270 aa  228  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1794  ABC transporter related  43.03 
 
 
257 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1066  ABC transporter component  41.8 
 
 
261 aa  222  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00480  ABC transporter, ATP binding component  46.72 
 
 
327 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2981  ABC transporter related  43.72 
 
 
273 aa  218  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2738  ABC transporter related  41.77 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2259  ABC transporter related  43.9 
 
 
274 aa  211  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2609  ABC transporter related  46.75 
 
 
247 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00433881  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2371  ABC transporter related  48.64 
 
 
228 aa  208  8e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.621592  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1090  ABC transporter related  30.8 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  28.83 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  25.33 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  26.34 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  26.79 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  26.34 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  26.79 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  26.79 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  25.45 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1945  ABC transporter related  30.1 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  25.33 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  26.48 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  27.6 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  31.37 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4690  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.28 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.834348  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3167  ABC transporter related protein  27.43 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.351033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  28.78 
 
 
235 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  32.08 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0430  ABC transporter, ATP-binding protein  32.65 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  29.72 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  30.28 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  32.08 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1693  hypothetical protein  31.19 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1141  ABC transporter, ATP-binding protein  31.44 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.08 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.08 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.08 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  32.08 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.08 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000765  ABC transporter, ATP-binding protein  26.37 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5201  bacitracin export ATP-binding protein BceA  25.99 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  35.33 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  26.58 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04880  ABC-type spermidine/putrescine transport system ATPase component  26.37 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.08 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  31.75 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0629  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.92 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  31.63 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  28.92 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  28.92 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  30.88 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  30.24 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  28.43 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  28.92 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.69 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  28.92 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  34.64 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  34.67 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  27.83 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.69 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  30.24 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  31.07 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2419  ABC transporter component  32.34 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  26.38 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  28.63 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  30.49 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1694  hypothetical protein  30.73 
 
 
363 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  27.69 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  27.09 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  29.9 
 
 
223 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>