More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0430 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0430  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
244 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.89 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.77 
 
 
235 aa  195  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 
235 aa  191  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.32 
 
 
233 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 
235 aa  189  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.84 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  46.82 
 
 
226 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  46.67 
 
 
233 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.67 
 
 
233 aa  185  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
233 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
233 aa  185  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
233 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
233 aa  185  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
233 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  46.67 
 
 
233 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
233 aa  185  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.22 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1619  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.98 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.281163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 
234 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 
234 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0831  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
233 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
233 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
233 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
233 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
233 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.33 
 
 
225 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  44.3 
 
 
235 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
224 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  46.51 
 
 
217 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.98 
 
 
235 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.05 
 
 
236 aa  178  7e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 
228 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.78 
 
 
252 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  46.09 
 
 
247 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.06 
 
 
247 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.18 
 
 
242 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  46.12 
 
 
227 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.05 
 
 
252 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.05 
 
 
231 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0796  ABC transporter related  45.38 
 
 
299 aa  175  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.05 
 
 
252 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.18 
 
 
242 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
227 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.59 
 
 
253 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.59 
 
 
253 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.59 
 
 
253 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 
240 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 
240 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.02 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.02 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1577  ABC transporter related  46.29 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.039457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.61 
 
 
238 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.89 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  39.65 
 
 
224 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.78 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0860  ABC transporter-related protein  44.1 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0674344  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 
223 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  46.88 
 
 
225 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.05 
 
 
253 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  44.17 
 
 
235 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.05 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2955  ABC transporter related  44.34 
 
 
250 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.05 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 
227 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  43.42 
 
 
226 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0759  hypothetical protein  42.79 
 
 
231 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44.55 
 
 
238 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  42.11 
 
 
224 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  39.65 
 
 
224 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.72 
 
 
249 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.56 
 
 
318 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.64 
 
 
230 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  42.22 
 
 
232 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.42 
 
 
229 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.6 
 
 
230 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  39.65 
 
 
224 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  39.21 
 
 
224 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  39.21 
 
 
224 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  41.33 
 
 
234 aa  169  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.67 
 
 
224 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  39.21 
 
 
224 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.61 
 
 
239 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  44.84 
 
 
707 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
230 aa  169  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  45.18 
 
 
235 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 
249 aa  168  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 
224 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 
224 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1480  ATPase  45.69 
 
 
235 aa  168  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 
224 aa  168  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 
223 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 
223 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 
224 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>