More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3326 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3326  ABC transporter related  100 
 
 
345 aa  695    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0346  ABC transporter related  72.7 
 
 
337 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00397781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0446  ABC transporter related  64.8 
 
 
333 aa  428  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1037  ABC transporter related  57.88 
 
 
332 aa  364  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2094  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
338 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2267  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 
336 aa  346  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0800991  normal  0.721323 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2106  ABC-type transport system, ATPase component  53.07 
 
 
351 aa  340  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1988  ABC transporter related  56.23 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0475  ABC transporter, ATP-binding protein  50.15 
 
 
351 aa  329  4e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02410  ABC transporter, ATP-binding component  55.52 
 
 
335 aa  326  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0985193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4261  ABC transporter related  50.15 
 
 
343 aa  322  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1674  ABC transporter, ATP-binding protein  50.74 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.826936  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1976  ABC transporter related protein  50.78 
 
 
333 aa  312  5.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00480  ABC transporter, ATP binding component  48.25 
 
 
327 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2371  ABC transporter related  63.01 
 
 
228 aa  275  9e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.621592  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2259  ABC transporter related  51.63 
 
 
274 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0681  ABC transporter related  51.63 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1400  ABC transporter related  49.8 
 
 
263 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.457533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1284  ABC transporter related  48.99 
 
 
262 aa  233  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0154  ABC transporter related  51.82 
 
 
260 aa  231  9e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1455  ABC transporter, ATPase subunit  51.01 
 
 
254 aa  228  9e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0680  ABC transporter related  50.2 
 
 
263 aa  226  6e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1276  ABC transporter related  49.8 
 
 
263 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.698379  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1683  SN-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein (UgpC)  43.6 
 
 
258 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0499  hypothetical protein  41.73 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1794  ABC transporter related  45.2 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2113  ABC transporter related  43.09 
 
 
270 aa  195  9e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2609  ABC transporter related  44.13 
 
 
247 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00433881  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0107  ABC transporter-related protein  44.09 
 
 
259 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1066  ABC transporter component  43.48 
 
 
261 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2981  ABC transporter related  41.27 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2738  ABC transporter related  40.4 
 
 
260 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0360  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  26.89 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0455  ABC-type sugar transport system, ATPase component  26.89 
 
 
493 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1814  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  26.89 
 
 
493 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.325907  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  26.89 
 
 
493 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0812  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  26.89 
 
 
505 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1103  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  26.89 
 
 
493 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  32.66 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  27.38 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  31.72 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  25.68 
 
 
240 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  32.66 
 
 
226 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  27.8 
 
 
250 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  29.82 
 
 
253 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3142  ABC transporter, ATP-binding protein  30.28 
 
 
253 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00969837  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1090  ABC transporter related  28.78 
 
 
259 aa  63.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3406  ABC transporter ATP-binding protein  29.82 
 
 
253 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0509815  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  32.3 
 
 
247 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  30.91 
 
 
259 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.88 
 
 
285 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.88 
 
 
285 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.37 
 
 
280 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  26.07 
 
 
405 aa  62.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  32.06 
 
 
269 aa  62.8  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  27.75 
 
 
233 aa  62.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  27.83 
 
 
262 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  27.59 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  27.59 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  31.47 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  27.59 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  25.85 
 
 
227 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  26.6 
 
 
250 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  27.09 
 
 
250 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  27.85 
 
 
235 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  27.09 
 
 
250 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  27.09 
 
 
250 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  27.09 
 
 
250 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  28.27 
 
 
256 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  28.22 
 
 
363 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  28.22 
 
 
363 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  27.09 
 
 
250 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  26.6 
 
 
250 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2275  ABC transporter related  30.05 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  27.8 
 
 
273 aa  60.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3052  ABC transporter, ATP-binding protein  29.36 
 
 
253 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  31.1 
 
 
236 aa  60.1  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  27.85 
 
 
799 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  28.92 
 
 
228 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  26.83 
 
 
269 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4786  ABC transporter related  30.93 
 
 
260 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276947  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  28.44 
 
 
250 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  27.19 
 
 
799 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  26.91 
 
 
274 aa  59.3  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  26.39 
 
 
408 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  29.02 
 
 
278 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  28.91 
 
 
365 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 
251 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  26.64 
 
 
235 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  24.32 
 
 
368 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  28.91 
 
 
241 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  27.98 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  31.05 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2892  ABC transporter, ATP-binding protein  25.3 
 
 
251 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4581  ABC transporter, ATP-binding protein  24.43 
 
 
256 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5085  ABC transporter ATP-binding protein  24.43 
 
 
256 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  28.77 
 
 
563 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  28.22 
 
 
252 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  27.59 
 
 
899 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  27.09 
 
 
903 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>