More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2342 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  100 
 
 		 259 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  70.28 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  63.11 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  65.16 
 
 		 253 aa  288  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  59.49 
 
 		 277 aa  270  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  60.45 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  57.55 
 
 		 276 aa  248  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  59.66 
 
 		 264 aa  248  9e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  61.9 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  54.58 
 
 		 286 aa  234  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  57.58 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  47.9 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2184  ABC transporter related protein  51.23 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0845202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  54.34 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  46.12 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1774  ABC transporter related  46.96 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  38.64 
 
 		 257 aa  164  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  39.61 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  32.66 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  42.36 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  38.36 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  38.68 
 
 		 250 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  42.73 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.85 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  38.03 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  38.81 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  39.41 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  33.73 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  38.76 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  38.61 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  32.66 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  42.13 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  44.15 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  42.92 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  35 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  47.8 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  40.21 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  43.62 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  37.97 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  44.44 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  35.29 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  45.21 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  43.32 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  39.33 
 
 		 273 aa  142  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  32.56 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  36.68 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  38.12 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  40.28 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  37.44 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  37.44 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  41.27 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  35.24 
 
 		 236 aa  139  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  41.86 
 
 		 247 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  40 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  34.53 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  36.14 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  39.9 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  37.56 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  37.56 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  39.91 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  39.57 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  36.6 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  37.56 
 
 		 246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  36.97 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  36.49 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  41.58 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  40.36 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  37.2 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  32.66 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  39.11 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  40.29 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  35.59 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  38.84 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  37.77 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  37.31 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  33.33 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  40.09 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  38.42 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  33.33 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  37.23 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  35.18 
 
 		 258 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>